作者mzac1b (Goodday)
看板Biotech
标题Re: [问题] DNA序列比对
时间Tue Mar 27 19:37:33 2007
※ 引述《pcboy (妞)》之铭言：
: 我想要比对至少10组以上的DNA序列
: 比较彼此之间的相似性
: 今尝试用ClustalW
: 不过工作网页只有一个贴序列的空白方格
: 理论上应该还有其他欲比较序列的空白张贴处
: 请问应该如何使用
: 或是有无方便的适用软体
: 谢谢大家
我猜你并没有使用正确的格式
一个软体辨识序列有特定的格式需求
比如说把十多个序列作成 .fasta 格式於一个档案
就是很常见的形式
我用过clustalx 它所能读取的就是fasta 格式
如果你只有十多组序列
其实可以开 .txt 的文字档自己制作符合该软体所能读的格式
除非序列太多如数百就可能得用到程式语言
但一切前提是你得知道该软体能吸收的档案格式是怎样
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.109.55.227
1F：→ pcboy:谢谢你的提醒，我会再努力试试正确的方式，谢谢 03/27 22:05