※ 引述《soom (是个呆逼)》之铭言： > ※ 引述《ubiquitin (幸福金金幸福)》之铭言： > > 我想抓所有蛋白质序列来分析 > > 之前有试过以 swiss prot 连结 UniProt > > http://www.expasy.uniprot.org/database/download.shtml > > 但是抓下来的fasta 档案似乎是所有生物的 > > 我用手提电脑跑 perl 写的程式 > > 结果记忆体不够.... > > 所以想先抓所有人类的蛋白 fasta 档就好 > > 只要人类蛋白的 > > 叙列名称和氨基酸序列 > > 请问众大大们 > > 要去去哪抓呢? > 同一个网页， > 画面的左侧有一个联结可以通向UniProtKB的ftp > ftp://ftp.expasy.org/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/ > 进去以後选taxonomic_divisions资料夹 > 在里面就有uniprot_sprot_human.dat.gz跟uniprot_trembl_human.dat.gz > 两个档案，可以自行选择需要的档案 > 希望有帮到你.. 我看他的 readme 提到 The UniProt Knowledgebase (UniProtKB) is the central access point for extensively curated protein information, including function, classification and cross-references. 所以 这个档案应该有包含一些功能 参考资料上的叙述 我想要找只有 fasta 档就好 感谢感谢 -- ◤◥ Origin: 中央生科˙生生不息 nculs.twbbs.org.tw ◣◢ Author: ubiquitin 从 leu.ibms.sinica.edu.tw 发表