作者hchs890843 (紫鱼)
看板Biotech
标题[问题] 有关於抽质体DNA的问题
时间Tue Apr 12 23:55:15 2005
我现在在实验室打工,然後会常常碰到要帮学长姐抽质体DNA的工作
一般的菌还好,可是每次我遇到一种叫VSVG的质体就完了
产率相当的低,每次可能都要多弄好几罐才能抽够
我现在是在作大量质体的制备,利用厂商设计好的工具说明来抽。
现在就我所学的,想到的只有一些原因
本身质体就很不容易被transformation到大肠杆菌里,因为比较大
本身VSVG的copy number数低(这是实验室的学长姐跟我说的)
想找寻一些对付这种low copy的质体DNA,我把一些学长姐提供的意见与自己的愚笨
想法一起贴上来,希望大家能给点意见讨论讨论>"<
学长姐的建议:
‧多养一些菌,在lysis buffer里面放比较久一点
‧尽可能的小心....
‧如果觉得很烦那就retransformation罗!因为可能当时的competent cell不够好
‧抽dna加isopropanol後,丢到-80 o/n,第二天再去抽
我的一些想法:
‧把菌养久一点,例如说我今天养500ml的菌,10小时後去抽。那我把养的时间加长
变成18或24小时之後再去抽,会不会比较好?或会更糟?
通常大家对这些细菌大约都养多久,或去测OD600时大约在多少左右是一个可能得到
较多的量?
我其实很担心这样菌会不会活太老然後就像做competent cell一样 失败
‧不用过column的技术,用传统的酒精沉淀法去做,据说这样可能尽可能的减低DNA黏
在column上的机会。不过这个传统技术有什麽先天限制吗?
‧用更高的转速转DNA:这有用吗?我是以抽病毒的方法去想的,想把病毒弄下来就是
要转快一点...
我观察一些菌的生长情形,像我们养的VSVG跟其他比较high copy的菌,总觉得它虽
然用同样的时间去养,可是就是感觉混浊度就比其他的菌低一些,有时还觉得它好像都
没长一样,跟昨天放下去的LB颜色差不多XD
↑有时候上面的天马行空版思考学长姐都觉得不太可能,可是...还是来问一下
大概就是这样了....板上的前辈谢谢你们看文章
如果前辈觉得这些资讯是可以自修被查到的
那可否提供大概的方向,要往哪里去找会比较好
我想我可以去看看,然後再把不懂的东西提出
总之谢谢各位
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 203.71.87.1
※ 编辑: hchs890843 来自: 203.71.87.1 (04/12 23:57)
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