※ 引述《[email protected] (goodday)》之铭言： : ※ 引述《[email protected] (我要当乖小孩了)》之铭言： : > 请问有可以自己打入sequence : > 然後模拟二级结构的软体吗 : > 我现在是用swiss pdb viewer : > 但只能看在pdb有档的protein : > 我想看点突变以後的二级结构 : > 有办法看吗 : > 希望有好心人士可以回答我 : > *^____________________________^* : > 谢谢 : spdbv : 其实有突变以及重计能量的功能 : 1. 按" mutate" : 2. 选一安机酸 , 并选择要变成啥 : 3. tool 选项选择 energy minimisation : 这样就可以了 : 但是我觉得没啥用 : 因为主要结构本来就决定 : 不会有太大改变 : 如果说要将一条序列完全重新计算能量 : 一般抓的到软体应该做不来吧 我知道有个国外网站 SWISS-MODEL http://swissmodel.expasy.org//SWISS-MODEL.html 这是利用网路连接的蛋白质结构模拟的伺服器来进行三维结构的同源模拟 应该是目前可以找到的模拟蛋白质结构的最方便的方法.... 这个网站他是把目前已解析完结构的蛋白质与蛋白质序列作个整理 依序列去预测可能的蛋白质结构..... 所以你只要丢出序列...然後它就会回e-mail给你..... 告诉你可能的结构为何..... 不过他的准确性仍有待商确.....(如果很准确的话..我们做结构的早就没饭吃了)... 这个网站详细的使用方法及原理.... 可以上google上去搜寻 中央研究院生物医学科学研究所 孙庆姝 所写的一篇 homology modeling 文章 中文的....还满详细的... 如果找不到的话我在寄给你....就这样...祝顺利... --

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