※ 引述《oplz (oplz)》之铭言： : 请问你觉得 Systems Biology 真的有可能成功吗? : SysBio 大量引进外领域的技术 特别是 Computational Bio. : 希望能用运算出整个系统运作的方式.. : 我的疑问是 真的有办法掌握所有外在变因 把系统视为一封闭的系统运算吗? 其实说引进外领域这句话有一点问题 因为我并不认为 systemsbiology 有领域上的限制 此外, 据我所知, 目前也没有人用纯计算的方式去预测生物系统 这些东西的根本还是实验数据. 因此, 在数据的限制之下得到的结果 才是目前可行的方法. 这样说来, 数据的完整性就很重要了. 至於有没有办法掌握所有外在变因, 我的回答是: 不行. 但是我只能说再某些实验条件下是可以得到某种程度的控制. 这是实验方面要努力的地方. : 另外 虽然 SysBio 现在很热 但如何提供足够的诱因使其它人愿意跳进来做? : 因为 SysBio 的 scale 似乎已超过 publication scale.. : 看看 human genome project, 前期跳进去做的 LAB 几乎全遭灭口 : 最後只剩下几间大的 CENTER 才能存活下来.. : SysBio 的规模更大更复杂..有可能自己单打独斗做出来吗? 这有点倒果为因, 因为不能说 "我想要作 systemsbiology" (除非你要做技术开发) 一般来说, 实验室都有暨有之方向 也有可能发觉一些很重要, 很有前瞻性的问题 如果 systemsbiology 是现今解决比较好的手段的话 (加上实验室能力允许 ... ...) 那就会有人愿意跳进来做 :P 不可否认的是, systemsbiology 的 scale 很大, 但是通常要看的问题很明确, 如何从问题点切入找到解答 算是实验逻辑的精华吧...这要看情形而定啊 ...XD 这和 human genome project 的问题似乎不太一样 前期的研究首重定序, 会失败我个人认为和研究发展的关系不大, 恶性竞争的成分可能还大些. 最後, 如果想要单打独斗做出来 是指一个人的话, 是有可能的 首先这个人必须对於基础科学相当了解, 然後会操作所有会用的机器 包括 MS, sequencer, 各式各样的 LC, 从养生物 (菌) 到纯化一手包办 还可以写个程式解决计算上面的问题 只是这样要花的时间太久, 没有效率, 而且实验室的建制也要够完善 因此大概没有人会想这样做. 因此合作还是目前的方法. 至於要怎样合作, 实验室的建制就相当重要. 这一点 ISB 做得相当好 可以让排定的程序顺利完成, 听起来简单, 要真正发挥 highthroughput 的 功能没有对实验室各部门有相当的控制与管理是没办法的. 就我的经验而言, 我完全可以不用担心技术方面的问题 而专注於我要解决的题目, 这是一个很有利的条件. 在 ISB 每一个技术部门不只是操作, 还同时具有研发的能力 这是不沦为纯操作服务的方法, 也是我们去学习主要的目标. : 另外 SysBio 的定义似乎到目前也没有一定的共识.. : 虽然 Leroy Hood 是 SysBio 的先驱 : 但也不是每个打着 SysBio 名号的人心中的定义都和他一样 : 我相信在跨领域的合作下会有突破 : 但有可能真的达到当出预期的目标吗? 哎呀...我也不知道 systemsbiology 到底定义成怎样 何必紧盯着字面上的解释不放 ? 请记住我们要解决的是生物学上的问题 而并不限定要用什麽领域. 想想看, 做个 genomic sequencing 跨了多少领域 ? 所以不能被领域所限制, 任何方法都是可能的手段 : 你能够说明一下你在 inst. SysBio 的研究内容吗? : 真的对这个 Sys Bio 有很多疑问 最後一并回答 systemsbiology 可不可能成功, 能不能达成预期目标. 目前的技术可以确保实验的成功是无庸置疑的 但是实验设计的目标有没有达成要看实验的深度 譬如说我今天先做 genomic sequencing, 再做 quantitative proteomics 建构 metabolomics 的基础, 这是一个所谓 systesmbiology 最初能给的东西 接下来可能会发现更多有趣的地方, 是不是要纯化某些蛋白质? biophysics, bioinorganic chemistry 的问题也要解决 是否可以回答演化层次的问题? 这都是一步一步来的 关於我在 Institute for Systemsbiology 做了什麽 简单的说是铜离子的浓度对於 M. capsulatus (Bath) 的影响. 此菌在不同 Cu 的外在环境会有很不一样的蛋白质 profile 对於甲烷氧化的机制也大不相同. 若您真有兴趣了解全部的细节 可以在台大总图用关键字 "嗜甲烷菌" 找一本 2004 年的化学系硕士论文 对应的 paper 已经发出, 但是因为图片的解析度被搞错 所以现在线上的版本没有什麽参考价值 XD (反正图也看不清楚) 等弄好了再贴上连结 :) -- 名称 规格 数量 价钱 备注 圆底烧瓶 14/20 5ml 1支 $55 二学分专用 圆底烧瓶 14/20 10ml 1支 $55 圆底烧瓶 14/20 25ml 1支 $65 圆底烧瓶 14/20 50ml 1支 $75 圆底烧瓶 14/20 100ml 1支 $80 --

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