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标 题Re: [问题] 基因定序
发信站清华生命科学 BBS (Mon Dec 17 00:39:41 2007)
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显然您不是生物本行
DNA 定序的原理建议找本分子生物学的教科书来看
找中译本就好
基本上是化学方法
实作上可能产生误差的原因很多啦
品质好的结果 错误大约是数千分之一吧
听起来不多 但是考虑总体来说需要定序的量 这样错误率就还是满高的
至於说 "直接观察" 的方法 是有人在开发不过目前发展有限
(相对上,化学法已经发展到可以用机器全自动了)
传统的 TEM SEM 大概是不可行 因为解析度不够
AFM "说不定" 可以,但是实作上的效率还多半是比不上高度发展的传统定序法
正确性也未必比较高(AFM 有时也有看不清楚的地方啊...)
※ 引述《[email protected] (科学主义)》之铭言:
> 【问题】:
> 基因定序的方式
> http://www.cbcb.umd.edu/research/assembly_primer.shtml
> 我从这个知道有很多方式,但大都是小片段组成原来序列的问题
> 那那个小片段是如何知道的?
> 这小片段是不是无法100%确定?错误率很高吗??
> 【问题起因】:
> 读一篇用电脑演算法来处理小片段重组成原序列的论文
> 它说到input(即小片段)会有error,想弄清楚这是怎麽回事
> 【个人看法】:
> 我想大概是用化学方式,还是用电子显微镜去看??
> 如果後者有办法做到,定序似乎可直接用影像辨视软体去处理?!
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