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标 题Re: 为何我的6xHis-protein在nickel column拉梯度?…
发信站Yahoo!奇摩大摩域 (Fri Nov 4 09:51:54 2005)
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> : > 为何我的6xHis-protein在nickel column拉梯度之初,就被洗出来?
> : > 我利用大肠杆菌来表现6xHis-protein,
> : > 经过IPTG诱导後,
> : > 破菌!
> : > 将上清液灌入nickel column,
> : > 在wash时, 没事!
> : > 但是在0~500 mM imidazole拉梯度(二十倍体积)之初,
> : > 我的6xHis-protein 在一开始(一倍体积)体积, 就被洗出来!
> : > 所以我的nickel column拉梯度图,
> : > 就在最前面只出现了一根很大根的peak!
> : > 然後就持平到最後,
> : > 经过western blotting分析後才发现,
> : > 我的6xHis-protein在前面这根很大根的peak里面,
> : > 但是这根很大根的peak里面还伴随着数百种蛋白质,
> : > 请问怎麽会这样呀?
> : 有几种可能
> : 1.你把His tag接在protein的哪一端?
> : 在N-ter的话因为它是先被制造出来的,所以很可能folding时被包进去了,造成binding能力不足.建议接在C-ter
> : 2.设计时的问题
> : 若His tag本身离protein太近也会造成tag无法随意飘动,或幅度太小,建议可於prtein与tag间加上一个cutting site (ex:factor X)反正也方便将纯化後的tag切掉,或者是多接一点His,我一般都用10个His喔
> : 3.实验准备上的问题
> : 你的column用了多次的话就应该要re-charge,或column中的EDTA或imidazole是否有清洗乾净.再者你的所有buffer是否有会干扰实验的物质,或你的梯度拉的太快,loading时流速过高,都会有所影响喔
> : 4.命不好
> : 其实做蛋白质实验常常会是听天由命的,表现量,纯化结果等等.基本上本人也发身过许多次.但基本上尽力而为罗
> 5.charge可以试试钴离子...
> binding较强
我没用过ㄝ...可以试看看..不过...好像比较贵对吧?!
> 6.试试GST或是MBP fusion protein吧....
> His-tag我觉得不太好用....
GST是不错..但一般的实验室不大会有纯化用的column..除非专门有在做纯化的.而且我记得价钱并不便宜.而且干扰基本上还是有.
BMP的话.他size也蛮大的喔.所以如果你的protein也很大.我就不建议.因为这样产量会变小很多.一般大protein出现的问题他也会出现.再者.如果你是要做分析等等.那你变得必须要先将MBP切下来.再分离一次(可以用size cut membrane)以免实验上被干扰或是被人质疑(毕竟His的影响不大).MBP通常是接在N-ter所以你的protein是接在他之後.其实有可能你的protein的结构会被干扰喔(我出现过一次)而且我是觉得binding效果普通啦.
但是如果你是较小的protein或是不可溶蛮多的,那我到觉得可以一试.因为BMP可以帮助folding及soluable,但是我学姊发生过一切下BMP他自己的protein就跟着挂了的情形(因为又变回不溶).若你是做结构的话..也可以试看看.因为BMP在解结构时会可以用MR代.会比较方便.
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