作者queenhassin (queenhassin)
看板Bioindustry
标题Re: [问题] 电脑模拟蛋白质制药的需求?
时间Sat Nov 23 01:28:54 2013
※ 引述《piimaila (肥仔)》之铭言:
: ※ 引述《ljii (是否)》之铭言:
: : HTS说穿了就很多很多种药物然後让机器人帮你作投药跟收data的动作罢了,
: 所以厂商基本上是乱枪打鸟? 还是预先知道药物范围?
要说药厂乱枪打鸟也是可以 不过这些HTS通常药厂自己内部会先做
比较少全部会交给pre-clinical公司
有些药厂自己内部做完初步筛选之後 再交给pre-clinical公司
这时候他们就有可能已经知道哪些药是有效(会跟receptor结合 or 引发下游讯号)
甚至已经知道某个特定浓度是IC50或EC50
当然也会有完全自己没测试过的 就是不知道自己做出来的药有没有效
这也是有的
: : 直接拿一百万个药去作HTS, 有100个well里的细胞死掉了
: 这样费用大概多少, 我参考一下兴大的费用
: 1 X 96 (每次筛选一个样品): 新台币 9,800 元
: 这样是说 一次一个蛋白质样品, 测试96种化合物
: 是不是这样呢? 当然 做多是有优惠, 但是一次拿100万个事不是成本非常高?
你看的是台湾的价格 其实台湾真正有在开发新药的公司非常少
HTS这块在台湾业界根本还用不到
收费多少 国际上一些公司的价钱通常是 well/60~100$ USD
别怀疑 就是这样 不管是96或1536 一个well就是台币一千元以上
药厂不会拿一百万个要去筛 他们自己内部会先筛
怎麽筛? 这是每家药厂的内部机密
筛完之後 交给pre-clinical公司的药量通常是100~1000之间
一支新药
检测receptor的话 可能只测一个浓度 药厂没在做三重覆的 通常是dupicate 两个well
检测下游讯号 一般都3~5个浓度 总共6~10个well
可以自己算算一支新药要花多少钱
: 那实务上又如何缩小范围?
: : 所以"仅"通过电脑筛选的都还需要进行大量的细胞和动物试验
: : 距离实际可用的资料还有很长的距离
: : 以这种低期望值的资料来说, 商业价值可能不会很高
: 恩, 这样 用电脑预测和用HTS的预测差在哪里呢?
: 是否通过HTS预测的就不需要细胞和动物实验?
不可能不做细胞跟动物实验
: 如果 HTS一样得通过细胞和动物实验 这样为啥要选择HTS不选择电脑筛选?
: 两者之间的差距差在哪里呢?
: 恩, 补问一个, 所谓的市场价值不是很高是大概一个可能性多少钱呢?
: 是否有交易成功的案子可以参考?.?
另外 在药物跟receptor结合方面 药物结合角度 卡的位置如何
这些是药厂会自己去分析 设计 改良
pre-clinical实验方面 只要结合就是结合 不会管你是哪个方位哪个角度
下游讯号也是
结合角度跟方位的影响 只有在进入动物阶段才可以看出影响为何
另外 pre-clinical没人在考虑什麽细胞质中一堆其他蛋白or 其他蛋白的干扰
真正好的药物 是非常非常specific的
所以 在进行pre-clinical检测时
所使用的receptor没人在纯化然後跟药物检测的
都是整坨整坨tissue 细胞均质完之後直接下去反应
电脑的分析 是不可能取代传统的分析实验的
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◆ From: 111.248.9.208
1F:→ ljii:这就是我说的盲点, 电脑模拟用的是纯化後的蛋白结构,但HTS 11/23 04:36
2F:→ ljii:用的是真正细胞内的状态 11/23 04:36