※ 引述《kzvito (HOW)》之铭言： : 原po现在在作的是预测protein seqeuence上， : 有哪些是会去interact的residue。 : 所以开始需要一些整理过的data set， : 但是在PLoS之类的地方， : paper好像都不会把自己的data set放上去， : 请问如果有作相关题目的人，或者有些了解的板大， : 除了写信找paper作者， : 还有乾脆自己去PDB之类的资料库抓protein来自己整理外， : 还有没有什麽途径可以找已经有人整理过的data set呢？ : ps如果有作类似的，欢迎交流一下~ Sorry~ 有点久才回这篇 首先，我想先说一下 "生物是一种活的科学"， 无时无刻都有可能发生改变与演进 因此在如何做资料收集也就会特别的重要 收集资料 不外乎就由paper上的资料或是自己找 paper上的资料又分两种 一种是帮你整理得好好的给你下载 另一种就是跟你讲他是怎得到的，言下之意就是请您去手动到相关的bio. DB去找寻， 但跟自己找的差异是 => 他已经跟你讲他抓的规则是怎样 不过我想说的重点不在於此，而是该找寻怎样的data set才是自己要的 要找data set之前得先定义你是要做怎样的题目，不同的定义、不同的题目。 在不同的时间点所抓的资料也会有所不同。 举你想要做的题目来说，你想要做的是protein interaction residue. 这时就要先定义何谓protein interaction residue? residue要与作用物上距离多少才算是有interaction? 再来这题目又可细分是要找protein protein interaction? 还是Zinc binding...... 因此你会根据你不同的需求去建立你所找寻的规则，进而得到你所需要的资料。 或许你会说那我直接引用别人的就好啦~ 但是我开宗明义就说明一件事 ─ 生物是活的！ 所以你需要确认现在这资料是不是最新的！ 不同的时间，同样的条件下，所得的资料也是会有些出入的。 嗯~ 讲得好像有点严肃 这边只是讲讲自己以前收集资料的一些小经验这样。 还有就算是拿别人的资料，最好还是能自己先判断，因为有时也会有误， 不论是排版错误，文章误植......等。 大概是这样罗~ --

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