我的硕士班研究是在protein protein interaction这一块， 但最近注意到我的sample很容易有aggregate或degrade的情形， 日前有找专门做proteomics的老师讨论过， 老师问我的蛋白有没有很多free cysteine residue（他建议我使用DTT、urea看看） 我手边有该蛋白质的序列，目前发表过的文献仅指出它有HTH motif 所以我这几天爬了文，在swiss prot、EMBOSS等网站摸索好久， 使用GDAP分析AA sequence→没有结果， 直接browse GDAP内的predictions也没有我的蛋白 ExPASy ProtParam的结果→Cys (C) 10 3.6%（这样算多吗？） motif scan（用了两种方式）→有看到ASN_GLYCOSYLATION、CK2_PHOSPHO_SITE、 　　　　　　　　　　　　　　MYRISTYL、PKC_PHOSPHO_SITE 其他还有很多结果是no hit之类的，不知道是不是因为我选错database？ （我是做链球菌的） 除了设计primer、blast看定序结果外，这算是我第一次接触这麽多生物资讯类工具 不知道还有没有什麽是我遗漏，或是该注意的呢？ 抱歉我是新手，所以问的东西有点乱七八糟...orz --

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