作者hgsfhevil (evil)
看板BioMedInfo
标题Re: [问题] 关於blast的用法
时间Thu Jul 3 21:25:49 2008
※ 引述《hgsfhevil (evil)》之铭言:
: 我知道blast是用来做序列比对的
: 但是有人知道blast可以用来"去除"序列相似度高的序列吗?
: 我目前知道cd-hit可以这样做
: 如果知道的话,可以先告诉我这指命吗?
: 谢谢大家
: ps:看来最近一堆人忙着赶论文,没时间发问了
恩,我主要是要做出non-redundancy的东西
我主要是做cluster的步骤
今天老师示范blastcluster
有人知道他要如何设e-value吗?
大家,给我的东西,我会尽力玩玩看,问老师可不可以用?
ps:好累,好想睡觉
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 118.169.70.84
1F:→ wewey:做cluster用cd-hit最适合吧 07/04 00:13