作者TZUKI (汉堡)
看板BioMedInfo
标题Re: [转录][求救] 有关FASTA format
时间Mon Jun 2 21:12:18 2008
不好意思
我可能没有说清楚
现在是 如果有人丢了以下一串东西给我
MAAIASTLSLSSTKPQRLFDSSFHGSAISAAPISIGLKPRS
FSVRATTAGYDLNAFTFDPIKESIVSREMTRRYMTDMITYAETDVVVVGAGSAGLSAAYEISKNPNVQVAIIEQSVSPGGGAWLGGQLFSAMIVRKPAH
LFLDEIGVAYDEQDTYVVVKHAALFTSTIMSKLLARPNVKLFNAVAAEDLIVKGNRVGGVV
TNWALVAQNHHTQSCMDPNVMEAKIVVSSCG
HDGPFGATGVKRLKSIGM
IDHVPGMKALDMNTAEDAIVRLTREVVPGM
像这种乱糟糟的感觉
而一般fasta格式通常是80或70个在一个column里面
而我应该如何将上面这组东西变成标准的格式??
希望有人可以分享经验m(_ _)m
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 134.208.44.23
1F：推 tinin:这是一条序列还是多条序列? 06/02 21:19
2F：→ TZUKI:多条 06/02 21:24
3F：→ TZUKI:他们原本都是正式的fasta format 但是变成这副德行= = 06/02 21:24
4F：→ auymle:转成fasta的目的是什麽阿...不然一般的程式直接把序列 06/02 21:33
5F：→ auymle:都进去都是可以支援的 06/02 21:34
6F：推 huggie:你这一串是真正有 ">" 开头的 fasta 序列对吧? 06/02 22:39
7F：推 huggie:试试看板友建议的转文工具..先把他转成另一种，再转回来 06/02 22:40
8F：→ huggie:搞不好这样就整齐了..这样最省事，再来就是自己写程式 06/02 22:40
9F：→ huggie:不过就像 auymle 说的，应该也无所谓吧? 06/02 22:44
10F：推 tinin:能不能给你想要的output格式?这样会比较清楚 06/03 00:11
12F：→ nightcatman:各种格式都能转 06/03 06:40
13F：→ nightcatman:不过话说回来,这种东西应该随便google都找得到吧... 06/03 06:41