作者abeautiii (小燕子)
看板Biotech
标题[求救] paper问题 拜托帮忙
时间Mon May 6 14:47:01 2024
各位先进好，有一些paper问题想请教
Paper标题：Tissue-resident memory CAR T cells with stem-like characteristics d
isplay enhanced efficacy against solid and liquid tumors
连结：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10313923/
主要是图看不太懂，很多图都是第一次看到，虽然上网查了很多资料，但还是对於paper
图的意义不理解
像Fig.1 的图A
https://i.imgur.com/yXsTY0p.jpeg
Flow的等高线图越密集应该是代表表现量越高吧，CAR-TRM右上(+,+)和左下(-,-)表现差
不多，这是代表什麽意思？
Fig.6的图I
https://i.imgur.com/MXm8Yuq.jpeg
这种图要怎麽看，CAR-TRM在有无CD103的情况下的表现，框框代表什麽，在框框内外是什
麽意思？没有查到y轴的SSH-H是什麽？
Fig.2的图A
https://i.imgur.com/lzqAQIa.jpeg
第一次看到PCA图，查的资料都是这是将资料降维，有三种主成份，但还是不懂点的远近
跟位置代表什麽意思
Fig.3的图A和Fig.S4的图B
https://i.imgur.com/Qa7z1Wr.jpeg
https://i.imgur.com/OxRiPcG.jpeg
也是第一次看到UMAP图，查到是相似的会聚集在一起？Fig.3这是收集细胞後扩增，利用s
cRNA-seq处理，再进行聚类分析，第一张是可以看出三种标记的表现量比较，点的数量就
代表表现量吗？第二张图的红点较多代表什麽意思，CAR-TRM的扩增较多？第三张完全看
不懂，这是代表细胞主要在哪个阶段吗？是CAR-Tconv还是CAR-TRM，这样也看不出量多寡
，点的位置有意义吗？
Fig.S4点的数量是表现量吗？这样是MKI67表现较多？还是要对照点分布的位置一起看？
拜托各位先进帮忙，可能很多笨问题，但真的研究很久还是不懂，谢谢您们！
如果内容太多，留言不太方便，可以站内信，谢谢！
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 223.137.140.21 (台湾)
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1F：→ memory0907: 个人觉得，如果没有flow cytometry和scRNAseq的概念，05/06 15:22
2F：→ memory0907: 实在很难用文字描述到让你明白…05/06 15:22
3F：→ xxtomnyxx: 大学？硕士？学科背景？有多少相关技术知识？ 05/06 21:04
4F：→ xxtomnyxx: 这些图都算简单的了，就算是第一次看也该能理解才对，05/06 21:05
5F：→ xxtomnyxx: 现在 Cell 和 Nature 上尽是些奇葩分析的奇葩图表，那05/06 21:05
6F：→ xxtomnyxx: 些真的有够难理解的。05/06 21:06
7F：→ xxtomnyxx: 然後常常在版上看到这类询问知识还想请人手把手教的文05/06 21:06
8F：→ xxtomnyxx: ，对於专业知识被如此廉价的看待感到很无奈05/06 21:07
9F：→ xxtomnyxx: 要给建议的话，我会说：你会看不懂是因为你的理解几乎 05/06 21:43
10F：→ xxtomnyxx: 都错了，请搭配文章内文的描述，去推测这张图要怎麽解 05/06 21:43
11F：→ xxtomnyxx: 读会符合文章想表达的意思 05/06 21:44
12F：→ abeautiii: 已解惑，谢谢 05/07 13:00
※ 编辑: abeautiii (223.137.140.21 台湾), 05/07/2024 13:00:55
13F：推 surgeon999: 3F 凶哦 05/11 13:11