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因为话多一点,所以回覆一篇讨论。 首先先谈我的经验与方法。我的经验是还是要从single colony 去挑出stable clone容易 很多。细胞适应抗生素活下来变成抗药性细胞真的没那麽难,且不带过量表现蛋白往往长 得比会表现过量蛋白来得好与快,几次继代後就没有了,所以容易挑出只有抗药性的细胞 。 你的clone有带萤光,我的经验来说从单一细胞挑不是很难挑。Transfection後一到两天 从显微镜下看到有萤光,直接算500或1000颗同时含有G418分种在96 well,大概1周後用 萤光显微镜观察,後续挑出只有长出一个clone且带萤光的well再放大,最後以WB确认ove rexpresstion即可。 那回到一开始的问题,细胞产生抗药性的方法或产生基因静默的可能性很多,如果真的想 知道之後再做讨论吧。但我相信这不是你当下想解决或是深究的重点,对你的後续实验也 无益,所以先暂时忘了它吧。 再来延伸出去的我想讨论的是“stable clone” 这件事,我遇到过有的老板会认为挑出s ignle colony的细胞不能完全反应这个细胞株的生理特性,因为这是“这颗细胞自己”在 受到强大的逆境後所产生出的新的特性,而不是“这群细胞”所表现出的特性,所以他们 反对这种做法。我自己在投稿也遇过reviewer针对我每个用“stable clone”的图提出质 疑,哪怕我已经用3个不同的stable clone验证我的结果,他revise每个“stable”也都 刻意标引号,最後我只好再以transient expression补一些实验他才放我过。但不是每个 人都会在意这点,不论是一群或是单一细胞的stable cell line我觉得还是先求有再求好 。 最後,要用什麽样的细胞株进行後续实验仍取决於你的老板是否接受,所以跟他讨论看看 吧。有萤光的细胞株要挑不会太难,所以别太气馁。 以上碎碎念供参。 ※ 引述《belzy (zy)》之铭言: : Transfect新手研究生 : 要做overexpressed stable cell line,Insert 後面接红色萤光当标记(有IRES也有 直? : 做fusion的组别) : 之前有先测试g418的浓度(800ug/ml) : 现在遇到的问题是,在筛选之後有一些不会表达萤光的细胞长得很好,跟有萤光的混在 : 分不开,是因为我一开始筛选的时候细胞不够散吗? : 分盘之後再筛,没有萤光的依然长得很好,已经会长得很均匀而不是团块的样子,还是 : 法只把有萤光的细胞分出来 : 想请问那些没有萤光却活下来的细胞,是萤光的promoter没有被推动但是g418的promot er : ,还是筛出了有抗药性的细胞??还是其他原因? : 还想请问我现在这个状况有什麽补救的方法吗? : 感谢各位前辈们 : 在stable cell line卡好久卡到想休学了…orz --
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 101.12.27.103 (台湾)
※ 文章网址: https://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/Biotech/M.1704417367.A.74E.html
1F:→ blence: 我猜会考虑dual marker是表现non-coding的分析方便 01/05 18:34
2F:→ florasflanaa: 之前听学姊说用sorter筛,我自己没做过不清楚正确 01/06 05:11
3F:→ florasflanaa: 性与细节,供参 01/06 05:11







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