作者nanoCup (奈米罩杯)
看板Statistics
標題[討論] 關於Hierarchical cluster analysis
時間Thu Oct 28 15:33:18 2010
最近在看一篇PAPER
"Colorimetric Sensor Array for Determination and
Identification of Toxic Industrial Chemicals"
是化學化工相關的文章
其中有個部分用到叫HCA(Hierarchical cluster analysis)
上網查了一些資料好像是統計方法的一種
不過因為不是專業的 所以看了老半天還是看不懂意思QQ
提供一張裡面的圖:
http://0rz.tw/Wpnm6
希望有懂這個方法高手簡述一下這個方法在做什麼
還有這個圖代表什麼意思...
還有橫坐標的squared Euclidean Distanse/1000是什麼意思...
萬分感謝!!
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.112.55.113
1F：→ gsuper:你有 21 個族群 , 假設是 rows , 再來你有量化的特徵 , 10/28 15:58
2F：→ gsuper:假設是 columns , 歐式距離的定義去查 wiki 10/28 15:59
3F：→ gsuper:任意選兩個 rows , 都可以產生一個歐是距離 10/28 15:59
4F：→ gsuper:最後利用這個距離將 21 個族群分類 , Hierarchical 的做法 10/28 16:00
5F：→ gsuper:是一直對半切 10/28 16:01
6F：→ gsuper:除那個 1000 對分類這件事情是沒意義的 , 可能要拿來當某個 10/28 16:02
7F：→ gsuper:解釋變數吧 10/28 16:03
8F：→ gsuper:或許你可以去生物資訊版問問看 10/28 16:04
9F：→ nanoCup:嗯~~謝謝你...我是不大懂這樣的圖是程式跑出來的還是? 10/28 16:05
10F：→ nanoCup:還有這張圖代表的結論? 10/28 16:05
11F：→ yhliu:階層式集群分析. 依某種方式定義原個體間的距離, 再依某種方 10/28 16:27
12F：→ yhliu:式定義個體與集群間、兩集群間之距離, 然後把距離最接近的個 10/28 16:29
13F：→ yhliu:體或集群併成一個集群. 輸出結果是分群的樹狀圖, 在不同距離 10/28 16:30
14F：→ yhliu:水準下可得不同集群數. 不管最後選取的距離水準、集群數如何 10/28 16:31
15F：→ yhliu:同一集群內的個體被認為是彼此間比較相似, 而不同集群的個體 10/28 16:32
16F：→ yhliu:是比較不相似的. 10/28 16:32