Assume the data are not heavily skewed. Take the average of S1-1, S1-2, and S1-3, and the avarage of S2-1, S2-2 and S2-3. Apply paired t-test to compare pre- and post- treatment average. 小小發個牢騷.不是針對個人 我在板上看到很多類似的問題, 都是實驗先做了才來找統計方法 請問你們做實驗前都不用寫study proposal嗎? 難道proposal裡不用先規劃好將來要用的統計分析方法嗎? 不用justify sample size 嗎? 一個嚴謹的研究不應該這麼隨隨便便的 ※ 引述《muchmoa (...)》之銘言： : 我的實驗是要分析細菌體內的蛋白質分佈， : 細菌會加入藥劑，所以會有施藥前後的蛋白質分佈差異， : 施藥前取樣為S1，施藥後培養一段時間再取樣為S2，都是在同一搖瓶裡培養， : S1和S2拿去跑膠，蛋白質點(1000+點）會呈現在膠片上， : 掃描膠片後就會有每個蛋白質點的量， : 因為跑膠容易有誤差，所以S1和S2都會跑三次膠， : 稱為S1-1,-2,-3和S2-1,-2,-3好了，所以我的重複實驗是跑膠上的重複實驗， : 現在我要分析S1和S2的差異，用independent t-test不太對， : 因為S1和S2都是同一搖瓶裡的菌，雖然菌會繁殖， : 若我的情況可以視為independent的話那就簡單了， : 用paired t-test的話，S1跟S2裡每一個重複實驗都可以是pair吧？ : 這樣有清楚點了嘛？不夠的話我再補充，謝謝喔 : ※ 引述《muchmoa (...)》之銘言： : : 由於先去搞其他實驗，所以這部分還是沒有解決， : : 有人回po說可以先求consistency，但如果consistency不高的話怎麼辦？ : : 直接捨棄那組數據嗎？ : : 很高的話只選其中一個數據或aggregate在一起， : : 這樣可以做t-test嗎？沒有standard deviation的情況下， : : 最後就是我這例子可以視為independent嗎？ : : 可以的話就簡單多了， : : 謝謝各位 --

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