R_Language 板


LINE

原po有來信指出大概有多少資料。 我試了 dbscan,請見下例。 library(data.table) library(dbscan) library(ggplot2) # 產生理想 1500 群的 20000 筆假資料 N <- 20000 d <- data.table( x1 = sample(seq(1:50), size = N, T) + rnorm(N, 0, 0.05), x2 = sample(seq(1:30), size = N, T) + rnorm(N, 0, 0.05) ) # dbscan # eps 參數要看情況抓一下,應該不會很難抓(因為你幾乎知道實際有幾群) # 可用的 eps 值和 0.5 可能差很多 res <- dbscan(d[, x1:x2], eps = 0.5, minPts = 1) print(length(table(res$cluster))) # 確實抓到 50*30=1500 群 d[, g := as.character(res$cluster)] # 取中心和每群個數 dc <- d[, list(x1c = mean(x1), x2c = mean(x2), N = .N), by = g] ggplot(d, aes(x = x1, y = x2)) + geom_point(size = 0.2) + ggtitle("raw data") ggplot(dc, aes(x = x1c, y = x2c)) + geom_point(alpha = 0.2, size = 2) + ggtitle("average per cluster") ggplot(dc, aes(x = x1c, y = x2c)) + geom_text(aes(x = x1c, y = x2c, label = N), size = 2) + ggtitle("number of raw data per cluster") ggplot(dc, aes(x = x1c, y = x2c)) + geom_text(aes(x = x1c, y = x2c, label = g), size = 2) + ggtitle("cluster ID") ※ 引述《w32123 (Ru)》之銘言: : [問題類型]: : 程式諮詢(我想用R 做某件事情,但是我不知道要怎麼用R 寫出來) : [軟體熟悉度]: : 入門(寫過其他程式,只是對語法不熟悉) : [問題敘述]: : 各位大神大家好~ : http://i.imgur.com/tbduH5L.jpg : 這個圖中的每一小坨是植物的位置 : 是先對每個點的光譜值做kmeans分四群後找出來的 : 四個頂點是邊界範圍 : 我想找出散布在圖中每一坨的中心點當作植物中心點 : 也想知道中心點的位置和個數 : Hclust我只放入了x,y座標讓他們分群可是感覺分不太出來QQ結果如圖 : http://i.imgur.com/mrC8b6c.jpg : 想請問有除了分群以外的方法嗎? : 另外想讓R自動決定分群數 有嘗試過elbow method : 但是都會出現Error: cannot allocate vector of size 91.4 Gb : 不知道自動決定分群數有沒有比較推薦的方法呢 : 先謝過各位大神了~ : 現有每個點的資料格式如圖 : 最左邊是序號 band1~4是光譜值 x,y是x,y座標 : http://i.imgur.com/UUPYeCU.jpg : [程式範例]: : plant.cluster <- hclust(dist(remain.plant.add[,1:2]),method = "ward.D2") : png("hclust.png",res = 200,width = 2259,height = 1549) : plot(plant.cluster) : dev.off() : #elbow method : elbow.k <- function(mydata){ : dist.obj <- dist(mydata) : hclust.obj <- hclust(dist.obj) : css.obj <- css.hclust(dist.obj,hclust.obj) : elbow.obj <- elbow.batch(css.obj) : k <- elbow.obj$k : return(k) : } : elbow.k(NDVI) : #Error: cannot allocate vector of size 91.4 Gb : [環境敘述]: : R version 3.5.0 (2018-04-23) : Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit) : Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200) : Matrix products: default : locale: : [1] LC_COLLATE=Chinese (Traditional)_Taiwan.950 : [2] LC_CTYPE=Chinese (Traditional)_Taiwan.950 : [3] LC_MONETARY=Chinese (Traditional)_Taiwan.950 : [4] LC_NUMERIC=C : [5] LC_TIME=Chinese (Traditional)_Taiwan.950 : attached base packages: : [1] stats graphics grDevices utils datasets methods : [7] base : other attached packages: : [1] ggplot2_2.2.1 NbClust_3.0 rgdal_1.3-3 sp_1.3-1 : loaded via a namespace (and not attached): : [1] Rcpp_0.12.18 lattice_0.20-35 crayon_1.3.4 : [4] grid_3.5.0 plyr_1.8.4 gtable_0.2.0 : [7] scales_1.0.0 pillar_1.3.0 rlang_0.2.2 : [10] lazyeval_0.2.1 rstudioapi_0.7 labeling_0.3 : [13] tools_3.5.0 munsell_0.5.0 compiler_3.5.0 : [16] colorspace_1.3-2 tibble_1.4.2 : [關鍵字]: : 分群、中心點、位置 --



※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 60.248.222.1
※ 文章網址: https://webptt.com/m.aspx?n=bbs/R_Language/M.1541166048.A.A19.html ※ 編輯: andrew43 (60.248.222.1), 11/02/2018 21:45:15
1F:→ obarisk: wush表示:為什麼不試試 supc XDD 11/02 21:53
2F:→ andrew43: 因為他先寫dbscan所以我先試這個... XD 11/02 22:07
※ 編輯: andrew43 (60.248.222.1), 11/02/2018 22:12:37
3F:→ andrew43: oh我懂惹。XD 11/02 22:34
4F:推 Wush978: 沒差吧... XDDDDD 能抓老鼠的就是好喵喵 11/03 00:06
5F:推 w32123: 謝謝您特地回文~dbscan有試出來了,只是eps的部分還在嘗試 11/03 01:41
6F:→ w32123: 要如何設定會比較好,非常感謝您! 11/03 01:41
7F:→ w32123: 謝謝大家熱心回應~ 11/03 01:43







like.gif 您可能會有興趣的文章
icon.png[問題/行為] 貓晚上進房間會不會有憋尿問題
icon.pngRe: [閒聊] 選了錯誤的女孩成為魔法少女 XDDDDDDDDDD
icon.png[正妹] 瑞典 一張
icon.png[心得] EMS高領長版毛衣.墨小樓MC1002
icon.png[分享] 丹龍隔熱紙GE55+33+22
icon.png[問題] 清洗洗衣機
icon.png[尋物] 窗台下的空間
icon.png[閒聊] 双極の女神1 木魔爵
icon.png[售車] 新竹 1997 march 1297cc 白色 四門
icon.png[討論] 能從照片感受到攝影者心情嗎
icon.png[狂賀] 賀賀賀賀 賀!島村卯月!總選舉NO.1
icon.png[難過] 羨慕白皮膚的女生
icon.png閱讀文章
icon.png[黑特]
icon.png[問題] SBK S1安裝於安全帽位置
icon.png[分享] 舊woo100絕版開箱!!
icon.pngRe: [無言] 關於小包衛生紙
icon.png[開箱] E5-2683V3 RX480Strix 快睿C1 簡單測試
icon.png[心得] 蒼の海賊龍 地獄 執行者16PT
icon.png[售車] 1999年Virage iO 1.8EXi
icon.png[心得] 挑戰33 LV10 獅子座pt solo
icon.png[閒聊] 手把手教你不被桶之新手主購教學
icon.png[分享] Civic Type R 量產版官方照無預警流出
icon.png[售車] Golf 4 2.0 銀色 自排
icon.png[出售] Graco提籃汽座(有底座)2000元誠可議
icon.png[問題] 請問補牙材質掉了還能再補嗎?(台中半年內
icon.png[問題] 44th 單曲 生寫竟然都給重複的啊啊!
icon.png[心得] 華南紅卡/icash 核卡
icon.png[問題] 拔牙矯正這樣正常嗎
icon.png[贈送] 老莫高業 初業 102年版
icon.png[情報] 三大行動支付 本季掀戰火
icon.png[寶寶] 博客來Amos水蠟筆5/1特價五折
icon.pngRe: [心得] 新鮮人一些面試分享
icon.png[心得] 蒼の海賊龍 地獄 麒麟25PT
icon.pngRe: [閒聊] (君の名は。雷慎入) 君名二創漫畫翻譯
icon.pngRe: [閒聊] OGN中場影片:失蹤人口局 (英文字幕)
icon.png[問題] 台灣大哥大4G訊號差
icon.png[出售] [全國]全新千尋侘草LED燈, 水草

請輸入看板名稱,例如:Soft_Job站內搜尋

TOP