作者rn940111 (卡比)
看板R_Language
標題[問題] 哪裡的R才是對的路徑?
時間Mon Dec 4 21:03:10 2017
[問題類型]: 版本安裝位置
[軟體熟悉度]:
請把以下不需要的部份刪除
使用者(已經有用R 做過不少作品)
[問題敘述]:
一般來說使用mirror下載的R.pkg 會安裝在 /Library/Framework/R.Framework/....
我安裝在這邊的版本是3.4.2
之前都是用遠端螢幕控制寫R,發現MacOS也能裝RStudio Server後就決定改用這個,
但是剛剛在安裝RStudio Server跟Hadoop的時候我是利用terminal下指令,
搞定了server之後發現RStudio吃的版本跟R GUI吃的版本不同
RStudio現在使用的是/usr/local/cellar/r/3.4.3,
也就是剛剛透過安裝server而指定的路徑
R GUI則是使用/Library/Framework/R.Framework/....
如果是在terminal開R,則是跟R GUI使用相同版本
在這之前RStudio跟R GUI使用的R版本與library路徑都相同,
但是現在兩者的路徑不同了。
(同時 3.4.2 無法判定Taipei時區,所以不能安裝某些包而使得R session出錯,
希望使用3.4.3!)
嘗試重新安裝R.pkg之後,RStudio的版本回歸正常,但是server版本仍為3.4.3
其實我不是很確定兩種路徑哪一種才是放在最正確的位置,
這樣我是應該選擇
1. 指定library的安裝與讀取路徑到原本的/Library/Framework/R.Framework/...
並且讓RStudio固定使用/usr/local/bin/R的版本(往後必須注意更新路徑)
2. 把library的所有東西複製到/usr/local/lib/R/library下,
並且往後固定把R安裝在這,讓RStudio以後都在這裡執行(以後別使用pkg安裝)
3. 改變RStudio的讀取路徑,並且把3.4.3的版本放到3.4.2之路徑下,
往後不使用terminal進行安裝(不確定是否會使得RStudio Server失效)
3的實際作法正在尋找中,但感覺應該是相對不實際的作法
[環境敘述]:
MacOS x64 (High-Sierra)
R version 3.4.3 / 3.4.2
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※ 編輯: rn940111 (140.109.73.198), 12/04/2017 21:16:53
1F:→ parcequetoi: 我以為library本來就沒有所謂"正確"的路徑,不都是自 12/04 22:01
2F:→ parcequetoi: 己視需要設定的嗎? @@ 12/04 22:02
3F:→ parcequetoi: Server跟Client放套件的路徑不同感覺也很正常 12/04 22:04
4F:→ parcequetoi: 題外話,我好奇在MacOS裝Server版有什麼功用 12/04 22:05
5F:→ rn940111: 我想要在外面用iMac跑,所以我希望server讀的東西跟我本 12/04 22:11
6F:→ rn940111: 機的版本一樣 12/04 22:11
7F:→ rn940111: 問題在於"正確的版本路徑"而非library library本來 12/04 22:11
8F:→ rn940111: 就是最好解決的 12/04 22:11
9F:→ andrew43: 有時候一個soft link就解決了。玩壞的機率也不大。 12/04 22:39
10F:→ andrew43: 不過我不確定library能不能直接餵食 12/04 22:43
11F:→ andrew43: 或在不同版間互通 12/04 22:43
12F:→ Wush978: 因為你是用homebrew 裝的rstudio server吧,所以預設會 12/05 15:45
13F:→ Wush978: 連到homebrew的R。方便起見,我建議你全部以homebrew 12/05 15:45
14F:→ Wush978: 的為主,把R.pkg的刪掉即可。這樣裝rJava等套件遇到問題 12/05 15:45
15F:→ Wush978: 的機會也比較小... 12/05 15:45
16F:→ bluecadence: 其實軟體版本也沒有什麼"正確"安裝的路徑,當然不同 12/05 19:23
17F:→ bluecadence: 作業系統傳統上有一些傳統的安裝路徑,可是那都是可 12/05 19:24
18F:→ bluecadence: 變更的。重點是自己指定要安裝在那,使用的時候路徑 12/05 19:26
19F:→ bluecadence: 有沒有指定正確(binary code or lib, etc)。 12/05 19:27
20F:→ bluecadence: 多個版本,有時候跑這版本有時跑那個版本,原因是 12/05 19:36
21F:→ bluecadence: 有時候你指定了絕對路徑,有時候你又沒有指定絕對路 12/05 19:36
22F:→ bluecadence: 徑,所以系統就按照可執行檔案路徑參數的優先次序抓 12/05 19:39
23F:→ bluecadence: 優先度高的路徑版本跑。不然就是有時候有你不知道的 12/05 19:40
24F:→ bluecadence: symbolic link 存在。 12/05 19:41
25F:→ bluecadence: 然後你的"library"是指R的套件(packages)的library嗎 12/05 19:45
26F:→ bluecadence: ?不同版本的R或許可以/或不可以共用library 如果R在 12/05 19:47
27F:→ bluecadence: 編譯的時候使用的條件不同。不過MacOS或許比較沒這問 12/05 19:47
28F:→ bluecadence: 題 12/05 19:47
29F:→ andrew43: 我支持全都從單一介面(如brew)建立系統。不然之後更新 12/05 22:49
30F:→ andrew43: 時都要手動確定很多設定,不是很方便。 12/05 22:50