作者sinclairJ (KEEP MOVING FORWARD)
看板R_Language
標題群集分析圖判斷各群並分別存檔
時間Sat Nov 21 10:53:01 2015
[問題類型]:
程式諮詢(我想用R 做某件事情，但是我不知道要怎麼用R 寫出來)
[軟體熟悉度]:
請把以下不需要的部份刪除
新手(沒寫過程式，R 是我的第一次)
[問題敘述]:
在群集分析完成後 會得到一個圖 像下面這樣
https://www.dropbox.com/s/3pylrxdjsdwouw3/hc1.png?dl=0
但看物件裡的資訊似乎只能查到order (圖中由左至右的資料順序)
再來是如果資料太多 分群圖也會雜在一起 要用order判斷停損的分群位置也不好判斷
試過幾個其他分群的套件 似乎也都有這個問題
之前這部分都是用人工肉眼判斷= ="但現在因為要加速分析的流程
希望在得到分群圖後 就能順便把同群的樣本存成一個檔案輸出
(我分群數的切法就是切最長的那條線 如下圖 我就會把樣本分成三群)
https://www.dropbox.com/s/wqjiiwja7b3nv2g/hc2.png?dl=0
[程式範例]:
hc=hclust(dist(iris[,-5]))
plot(hc)
hc$order #names(hc)
>
[1] 108 131 103 126 130 119 106 123 118 132 110 136 141 145 125 121 144 101
137 149 116 111 148 113 140 142 146 109 104 117...
感謝各位先進前輩提點
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※ 編輯: sinclairJ (203.163.211.139), 11/21/2015 10:57:06
1F：→ allen1985: cutree(hc,k=3)? 11/22 12:35