作者yaowei2010 (yaowei)
看板R_Language
標題Re: [問題] 撈資料
時間Wed Aug 20 18:28:10 2014
不好意思 讓回復的大大看不懂我的問題 只好重新回一篇
gene_a Chromosome gene_start gene_end | Probe_b Chromosome2 Chr_s Chr_e
A 1 25000 50000 | a1 2 175 200
B X 1000 2000 | a2 4 600 625
C 2 0 800 | a3 1 23575 23600
| a4 X 1010 1035
| a5 1 30000 30025
我想做的是
先對Chromosome是不是在一個→再對位子→假設兩者都相符，收data(不符丟掉
例如上面兩data
probe a3和a5都為chromosome 1 兩位子分別23575~23600及30000~30025
A gene為chromosome 1 ，其位子為25000~50000，上述a5 probe都符合其chromosome
以及gene範圍，歸類到gene A裡的match中
我的想法是兩關，第一關篩選出和gene一樣的chromosome的probe
第二關比較probe的數值要落入gene的位子範圍中(gene_start~gene_end)
大概是這樣> <
以此類推
最後才變成
gene_a match_probe
A a5
B a4
C a1
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1F：→ yaowei2010: 補充 Probe和gene的數值全都是numeric 08/20 18:31
2F：→ yaowei2010: 位子範圍就是指start~end 08/20 18:31
3F：→ koai: 請確認 A gene 有match到 a3 嗎?? 08/20 18:31
4F：→ yaowei2010: 阿 沒有@@" 眼殘惹 08/20 18:33
5F：→ yaowei2010: 那大大得應該是對的 謝謝指正與指教!! 08/20 18:34
※ 編輯: yaowei2010 (140.112.129.5), 08/20/2014 18:35:22
6F：→ yaowei2010: 文已修正 08/20 18:35