作者zzxxzz (射☆惹ㄦ!!!!!!)
看板Chemistry
標題Re: [閒談] 化學合成路徑設計的電腦軟體發展
時間Thu Nov 21 07:32:01 2013
延續這個話題，我做全合成有些心得。
1.需要創意
有些關鍵的骨架改變是預先保護某幾個官能基，
之後再用酸、鹼、自由基放鬆整個骨架，
藉由Baldwin's rules預測或純化分析所有產物才有機會找出有機會的路徑中間體。
舉個例子，
http://ppt.cc/yQcM 知道15到16會這樣重排我都要想很久才看懂了，
全世界只有幾個人能想出來的創意，電腦軟體也是人做的，它創造力夠嗎?
2.反應性資料量不足
Green's 保護基附錄很豐富，可以預測保護基之間的互斥性；
但是隨便一個官能基轉換就有十種以上的藥劑可選，
怎麼知道無數種藥劑對無數種骨架(醣、酯、生物鹼、蛋白質...)和其上面保護基
的反應性?不只要知道反應機構還要能預測不同溫度、時間、當量產生的不同結果，
才有可能成功。
問題是:全世界有哪個期刊、哪個讀者想知道會失敗的反應?
大家都馬想撿現成、改良後的條件，怎樣做理論可行但實際上會失敗
是只有當事人花時間、力氣、金錢才能得到的寶貴(?)經驗。
我有遇過一個去保護反應試過文獻上20幾種藥劑都失敗，
只是骨架有個chiral center不一樣反應性就差很多了，
最後還是靠創意使用2種藥劑1 pot反應解決的。
一句話:經驗和創造力不是用理論預測就能取得的。
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◆ From: 140.109.55.226
※ 編輯: zzxxzz 來自: 140.109.55.226 (11/21 07:39)
1F：→ hadessage:是阿 期刊上的不一定正確 軟體無法取得正確有效資料 11/21 08:16
2F：→ hadessage:到最後還是要人力來測試判斷 11/21 08:16
3F：推 evanzxcv:所以主要問題是期刊不會系統性記錄失敗的反應 11/21 09:24
4F：→ evanzxcv:加上理論化學仍不夠強大,無法100%正確預測已知試劑或反應 11/21 09:25
5F：→ evanzxcv:條件下未知結構的反應性與相容性 11/21 09:25
6F：→ evanzxcv:還有一個很大的問題是,軟體無法發明新反應 11/21 10:28
7F：→ evanzxcv:記得Corey曾和一些程式設計師合作發展這類軟體,並獲得一 11/21 10:29
8F：→ evanzxcv:定的成功,但後來讓他們不滿意之處就是這點 11/21 10:30
9F：→ evanzxcv:就算軟體可能可以預測新反應途徑,還是要動手做才知道 11/21 10:30
10F：推 jessti:軟體發明新反應就跟用想的就能做實驗一樣，那還用做什麼？ 11/21 13:49
11F：→ jessti:人名反應中出自意外發現再優化的遠多於出自設計再實證 11/21 13:51
12F：推 sisay:CAMEO? 11/21 23:38
13F：→ Adwin:這就是作有機合成的樂趣啊，如果都可以被預測出，就不必 11/22 11:28
14F：→ Adwin:作研究了。 11/22 11:28
15F：→ RolfP:請問 15~16是怎打的.... 11/25 23:14