作者kingtiger (~（⊙ｏ⊙）~)
看板Biotech
標題[求救] 未知序列的物種promotor找尋
時間Thu Dec 16 21:23:02 2010
想請問如果要在未知(未定序)序列的物種中找到他的promotor
是否可用5' RACE PCR
或是有其他方法可以得到
基本上是以真菌類(無intron的genomic DNA)的情形
如果已知其cDNA
是否可直接設計反向的primer做sequence就可以得到上游的promotor區域?
以上請教大家,多謝
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.109.40.29
1F：推 yawai:5' RACE 只能做到cds的部分 還是要用genome walker 才行 12/16 21:49
2F：→ Ianthegood:mRNA是從+1開始吧 promoter有一大半都在前面勒 12/16 22:06
3F：→ geniusbing:5' RACE 可以做到5'UTR 不是只能做到CDS部分 12/17 10:07
4F：推 leoblack:所以應該說5'RACE是對ORF的起點作search~是嗎?! 12/17 10:23
5F：推 Ianthegood:transcription start site比ORF多一段喔 翻翻分生唄 12/17 18:40
6F：推 relaxsleep:真菌不是有intron? 我記錯哩嗎@@... 12/18 00:49
7F：→ Ianthegood:細菌沒有XD 真菌應該有吧 12/18 13:31