作者over999 (唉呦)
看板Biology
標題[問題] Sub-cellular localization網站
時間Tue Nov 15 20:40:54 2016
請問我想找關於基因表現出的蛋白
在細胞中的位置 除了GeneCards和 Human protein Atlas之外 有更好的網站有標出Sub-c
ellular localization嗎
謝謝!
BTW 我還想問
Metacore/IPA等大資料庫中的Subcellular 是準的嗎 有些基因在網站跟軟體中寫的位置
不太一樣欸
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※ 編輯: over999 (101.12.135.167), 11/15/2016 20:50:20
1F：→ blence: 會這樣問是因為你不相信genecards與protein atlas嗎?11/15 21:43
主要是因為Atlas資訊很模糊 只會顯示 核/胞內/膜/胞外 有些膜蛋白我沒辦法看出來是
內膜蛋白還是穿膜/外膜蛋白
GeneCards則是用評估值
膜5分/質4分/骨架5分/核3分
有時候遇到膜 核都五分 就不知道是核膜還是細胞膜
所以我現在都是結合網站及軟體 再找paper 但是我的基因數量有點多 想說有沒有比較有
效率的方式
※ 編輯: over999 (101.12.135.167), 11/16/2016 09:28:18
※ 編輯: over999 (101.12.135.167), 11/16/2016 09:30:10
2F：推 lelojack: GO enrichment分析是你最簡單的解 11/16 23:07
3F：→ Ianthegood: kegg IPA基本上就是人家幫你唸過paper啊 自己確認吧 11/18 03:51