作者Acespirate (飛)
看板Biology
標題[問題] 人類與黑猩猩的基因體差距
時間Sun Mar 13 21:35:37 2016
各位好
想請問人類和黑猩猩的基因體差距僅1.2%是怎麼比較出來的
兩個物種的genome是不同的
所以我知道是無法以整個genome比較
想請問這1.2%是比較是那些範圍的?
exons only? 還是和基因表現有關?
謝謝大家
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2F:→ lelojack: l?mlss=713 03/15 22:45
3F:→ lelojack: ensembl有genome browser看glbal alignment結果 可以回 03/15 22:46
4F:推 lelojack: 在coding區域黑猩猩有98%對到人類 而人類95%對到黑猩猩 03/15 22:48
6F:推 lelojack: 5%的差異代表exome區域有1百萬個SNP!!!!!!! 03/15 22:54
7F:→ airrooco: 推樓上~ 03/16 18:03
8F:推 setu: 黑猩猩是chimpanzee吧?不是gorilla 03/16 23:51
9F:推 setu: 第二 l大的附圖是比較人類跟gorilla ref genomes,在aligned 03/16 23:57
10F:→ setu: regions 有1%差異 不是5% 而這個比較也不是完全正確 但是是 03/16 23:57
11F:→ setu: 可接受的粗估值 03/16 23:57
12F:推 setu: 1.2%的差異一般是取多個人跟大猩猩的全基因體染色體序列(ali 03/17 00:04
13F:→ setu: gned)相互比較取平均值 03/17 00:04
14F:推 twnndnpdnc: 不是拿粒線體的DNA來比對的嗎? 04/14 14:14
16F:→ twnndnpdnc: /36041/amp 04/14 14:21
17F:→ twnndnpdnc: 更正,是全部的鹼基,我記錯了,我現在比較好奇,染色 04/14 14:21
18F:→ twnndnpdnc: 體數目不同是如何做比較的? 04/14 14:21