※ 引述《yffurdyeknom (Unhurried Justice)》之銘言： : ※ 引述《tonylaio (包子王子)》之銘言： : 請問大大這是我寫考古題碰到的問題 : 請問某一個酵素的active site 中有一個glutamic acid 相當重要可以參與反應 : a.此Glu可能具有什麼功能 : 我想可能是R group上的carbonyl group在酵素中提供一個electrophilic site，而 : 這跟酵素可進行的反應就大有關係(可以固定住多電子的反應物或和nucleophile進行 : 初步反應)。 補充一下 Glu也可能利用cabonyl group和cofactor形成離子鍵(ex:Mg) 利用cofactor穩定substrate催化反應 : b.將Glu更換為proline對此酵素結構活性可能有什麼影響 : 可以注意到的是proline有一個環的結構，而如果將Glu換成Proline的話，可能會造成 : 酵素無法正確的摺疊，因為環的angle strain比較大，無法像線型的amino acid提供 : 較大的摺疊彈性，如此，酵素就有可能失去活性。 1.跟Y大講的一樣由於imine ring角張力大會破壞alpha-helix及beta-sheet甚至造成turn 破壞酵素的正常摺疊 2.因為帶負電荷的Glu被nonpolar的Pro取代後無法催化酸鹼或親核等反應 : c.將Glu更換為arginene對此酵素結構活性可能有什麼影響 : 我還沒讀過有關imine的反應，所以這題就有請其他高手來回答啦~~~ : 不過我猜這跟carbonyl group和imine之間的差異有關係 應該是換成Arginine吧? 當帶負電荷的Glu換成帶正電荷的Arg使活性區改變 可能破壞離子鍵無法與受質、水、cofactor結合..... 而帶正電的Arg也可能和附近帶正電的residues產生排斥改變構型(上面那個比較重要) 我想的到的大概是這樣 -- ┌┬┬┬┬┬┬┬┬┬┬┬┬┬┬┬‧┬┬┬ ◤◣ ┬┬◤◣┬┐ ├┼┼┼┼┼┼◢█￣╲┼◢█￣╲┼┼┼┼┼ ◤ ◣┼┼┤ ├┼┼＊┼┼┼██ ▕┼┼┼┼╱┼┼┼┼┼ ● ● ┼┼┤ ├ ┼┼┼┼┼██ ▕┼┼◢￣┼┼┼┼┼┼ ◣ . ◤┼┼ ├┼┼┼┼┼┼◥█ˍ╱╲◢█ˍ╱┼┼＊┼┼┼◤ ◣ ┼┼┤ └http://www.wretch.cc/album/jack3172 ┴┴◣ \ / ◤ ┴┘ --

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