作者qwert0403 (qwert)
看板Bioindustry
標題Re: [問題] 電腦模擬蛋白質製藥的需求?
時間Fri Nov 22 10:32:07 2013
※ 引述《piimaila (肥仔)》之銘言：
: ※ 引述《piimaila (肥仔)》之銘言：
: 關於上次請教各位前輩, 我去問了一下相關問題
: 當然, 我非本科, 是依照我很粗糙的理解...orz
: 我聽得懂得附在文章最後面, 聽不懂得等我查個資料拿來請教
: 首先延伸出一些問題.
以前我實驗室也作這個，老師買個七十萬電腦，很貴的軟體，不知道多少錢
實驗室啥演算法都不懂,頂多聽廠商建議參數調，根據解出結構的酵素，選個區域，
去套小分子結構，
你可以隨電腦算，或是畫個主結構，電腦算其他結構，然後去合成跟作分析
不知道是我門合成技術太差還是化合物根本合不出來，蠻多結構都合成不出來
就算合出來，去做實驗也沒用或是效果很差，
我在實驗室三年，跟前後兩三年沒聽到成功過
最後高級電腦變 世紀帝國伺服器，爆快
反而是傳統慢慢篩藥，再慢慢做結構修飾，每兩三年都有成果
我對電腦設計藥物的感覺跟學長討論，
有結構也是結晶結構，可能跟生物分子在水裡差很多，化學力知道多少，但是一堆
化學力的交互作用，最好算的出來，或是有誤差，這誤差就讓你做不出來
算出來的東西，也可能在化學上根本合不出來
跟友和買藥物庫 乖乖篩藥比較實際
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 211.76.175.171
1F：→ qwert0403:我在實驗不是作藥物設計跟合成的 只是看看學長作問一下 11/22 10:34
2F：→ puec2:而且友和正妹多，買library大家都開心。 11/22 10:59
3F：→ qwert0403:藥物庫很貴 從幾十萬到幾百萬都有 業務爽翻 11/22 11:25
4F：推 ljii:XD二樓這...... 11/22 11:52
5F：推 darksaber:買藥物庫都是主管出來談,遇不到正妹啦 11/22 14:22
6F：→ piimaila:根據鄙人的經驗, 做這方便的電腦不貴, 但方向要對 11/22 16:00
7F：→ piimaila:只要方向對, 一個10萬左做的機器和最佳化的軟體 11/22 16:01
8F：→ piimaila:速度會超過上千萬的cluster但錯誤方向只用通用軟體的電腦 11/22 16:02
9F：→ piimaila:而且不知道是我印象錯誤還是怎樣, 台灣有哪個教授做這? 11/22 16:17
10F：→ piimaila:是否可以題點一二, 印象中只有一位李姓教授有做 11/22 16:19
11F：→ piimaila:我說的是藥物方面 而非演算法~ 11/22 16:21
12F：→ piimaila:當然拉, 那是古早記憶了@@ 現在就不太清楚 11/22 16:27
13F：→ piimaila:而且那論文說真的很克難, 而且...有種不為人知的味道在 11/22 16:28
14F：→ piimaila:似乎是學生有能力 但是教授不太清楚的感覺 11/22 16:29