作者XYH (拉回即是埋點)
看板BioMedInfo
標題[工具] OMIM之同一欄位內多個Gene/Locus代表意義
時間Tue Jul 19 19:23:55 2011
想請問板上的大家，
最近小弟在查詢OMIM基因的時候有些問題不太懂。
就是譬如今天利用Gene Map查詢精神分裂症(Schizophrenia)，
我們大概會得到某筆資料:
http://ppt.cc/_xPU
Location | Gene/Locus | ...略...| Gene/Locus MIM number
| | |
1:203,148,058| CHI3L1, GP39, YKL40, ASRT7| | 601525
1q32.1
￣￣￣
我有點進去601525的欄位，
裡面有一行
HGNC Approved Gene Symbol:CHI3L1
所以我想要解釋這資料可能跟HGNC有關係。
不知是否是下面我所寫的這樣?
「與精神分裂症有關之基因有OMIM代號601525之項目，
其基因英語慣用代碼為CHI3L1,GP39,YKL40,ASRT7，
惟上述基因命名時有因各國研究系統而有差異，
基本為同一基因，
於HGNC統一命名為CHI3LI，
其餘GP39、YKL40、ASRT7廢棄其名稱。」
請問板上的前輩，
是我想的這樣嗎?
感謝大家。
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 203.64.84.219
1F：→ hwjuranus:應該不算是廢棄，但是以HGNC的Gene Symbol為標準 07/19 20:58
2F：→ hwjuranus:其他的算是別名=alias 07/19 20:58
3F：→ auymle:樓上正解, 這些名子代表的都是同一個Gene 07/19 23:32
4F：→ XYH:謝謝大家喔^^ 07/23 14:07