作者huggie (huggie)
看板BioMedInfo
標題[問題] 基因數目
時間Thu Jun 5 19:51:34 2008
請問現在認知的人類基因數目個要從哪邊找?
我只查到這個...不過這是2004年的東西了
http://www.nature.com/nature/journal/v431/n7011/full/431915a.html
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◆ From: 140.129.160.62
2F：→ huggie:ensembl 是不是哪邊也找得到資料? 06/05 20:24
4F：→ auymle:但這些報導都focus在protein-coding genes 06/05 20:54
5F：→ auymle:其實還有很多noncoding gene還沒被發現 06/05 20:55
6F：→ huggie:原來 RNA 那些定義也算 genes? 06/05 21:09
7F：→ huggie:我剛1F panther pie chart 那個是 reviewed refseq,選 all 06/05 21:09
8F：→ huggie:數目是 25431 06/05 21:10
9F：→ huggie:auymle這篇不錯...至少有個reference. =) 06/05 21:11
10F：推 nightcatman:small RNA算基因啊 而且大部份都扮演調控的重要角色 06/05 21:12
11F：→ huggie:了解 06/05 21:12
12F：→ windincloud:夜貓大 照你這樣說 siRNA miRNA也是基因? 應該不是吧~ 06/05 21:40
13F：→ windincloud:基因通常我們指的是functional gene吧 :P 06/05 21:41
14F：推 auymle:miRNA當然也是gene 他們也有function 06/05 21:46
15F：→ auymle:注意喔 siRNA指的是外生性的small RNA, 他不是生物體 06/05 21:48
16F：→ auymle:自己產生的, 而是外來的 06/05 21:48
17F：→ windincloud:哈 我了解我誤會在哪了~ 拍謝 我以為這邊要問的gene是 06/05 22:05
18F：→ windincloud:model 所以才會說miRNA siRNA 非基因 XD 06/05 22:06
19F：→ windincloud:^ gene model 少打 06/05 22:07
20F：→ huggie:我知道miRNA有功能，但是我不曉得他們也定義為 "gene" 06/05 22:08
21F：→ huggie:雖然常常聽到 "no-coding RNA" 06/05 22:09
22F：推 Goldexp:現在已經發現endo-siRNA囉 06/05 22:29
23F：→ Goldexp:會從transposon, long hairpin和cis-NAT region產生 06/05 22:30
24F：→ huggie:endo-siRNA? 我一直以為 siRNA 跟 miRNA 結構一樣呢.. 06/05 22:53
25F：推 Goldexp:endo-siRNA 是21nt miRNA長度就較不一定 06/05 23:22
26F：推 auymle:應該不是這樣定義的吧?? 06/05 23:28
27F：→ Goldexp:endo-siRNA會被hen1 modify miRNA沒這樣現象(in animal) 06/05 23:28
28F：→ Goldexp:不是這樣定義沒錯 這只是從deep-sequencing觀察到的差別 06/05 23:30