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做一點補充: 近幾年來 無論國內國外 漸漸開始把生物資訊 改稱為生物醫學資訊 (e.g. Bioinformatics Institute --> Biomedical Informatics Institute) 細看這個名詞可以發現 生物到醫學 即是基礎到臨床 這個領域便是希望藉由資訊 技術 整合兩個點為線 進而加速其發展 此版已此為名 當然也是希望更多在這條線上的人們 可以藉由這個版 凝聚不同領域的共識 創造互通互信的語言 更能找到為彼此連結的那條線 ※ 引述《huggie (huggie)》之銘言: : 政見 : 生物醫學資訊是一個相對新興、跨領域的學門。國內投入此領域已有數年, : 但也許是這個領域人數不多的緣故,缺乏專屬溝通的平台。過去其實也曾經 : 有生物資訊專門論壇設立,但知道的人不多,參與的人更少。其實除了生醫 : 資訊人以外,今日的生物人在研究中,也往往不脫廣義的生物資訊的範疇。 : 何謂生物醫學資訊?生物醫學資訊是藉由資工、統計、數學、生化等來研究 : 生物以及醫學的議題。在生物學方面,在三千多個物種的基因體定序完成的 : 今日,以及各種高通量實驗資料的出現,對於進一步了解生物學提供了機會 : ,但也造成了分析上的困難。在醫學方面,隨著各種基礎設施的建構,加速 : 了對於各種臨床數據的蒐集,也希望能對這些資料進行分析,歸納出對於診 : 斷以及治療有用的資訊。本質上似乎這是兩個議題,但共同的是,希望藉由 : 跨領域的人才一起研究一堆看似雜亂無章的數據,提出進一步的假設。 : 生物資訊具體的分析在參考 Wikipedia 以及 Bioinformatics.org 之後, : 或許可以粗分成以下幾類(概略的分法,各領域之間有不少重疊部份): : 序列分析/比較基因體學 (Comparative Genomics) : 基因註解 (Genome Annotation/Gene Finding) : 資訊演化生物學 (Compuational Evolutionary Biology) : 基因表現分析 (Analysis of Gene Expression) : 蛋白質表現分析 (Analysis of Protein Expression) : 功能性基因體研究 (Functional Genomics) : 蛋白質體學 (Proteomics) : 結構基因體學 (Structural Genomics) : 系統生物學 (Systems Biology) : 醫學資訊則牽扯到基礎建設的建立,例如蒐集並且處理資料,以及對這些資 : 料做進一步的推論。由於本人(huggie)對這方面不是非常的了解,因此先 : 且略過。有待於對醫學資訊琢磨較深的板友來補充。 : 以上是較詳細的定義,但廣義的來說,任何藉由電腦來處理生物或醫學資料 : 的方法即是生醫資訊。舉凡資料的存取、分析、以及預測,皆為生醫資訊的 : 一種應用。因此,我想不只生醫資訊人能受益於此板的討論,也希望生物人 : 能多多利用這個平台,只要不是單純 wet bench 實驗上面的問題,牽扯到 : 工具方面的使用,就是本板的好問題。 : 因此,本板的討論範圍很廣泛,暫分為以下幾項: : 1. 工具 : 網路資源例如 NCBI、PDB 以及各式資料庫,或者分析工具例如 BLAST、 : Sequest等,凡是在研究中所遇到的,工具上的使用皆為此類。 : 2. 程式 : 生物資訊傳統上比較常用的程式為 Perl 與 Java ,但其他工具如 C, : Python 等使用的人也不少。凡程式方面,比較需要生物背景知識相關 : 的,例如相關套件使用(BioPerl,BioJava,BioPython 等),或者是 : 比較基礎的程式問題皆規於此類。 : 3. 用語 : 由於是跨領域的學科,許多人背景另有專攻,剛接觸這個領域時不免對 : 於一些簡單的基本英文用字有不少障礙,看期刊頗有困難,普查字典也 : 不得其解(本人曾深感其苦,現在也尚未完全解脫)。希望生物背景較 : 扎實的板友能為初踏入此領域的人解惑。相對地,生物背景在接受資訊 : 方面的訓練的時候或許也有類似困擾,也希望大家能傾囊相助。 : 4. 其他研究問題 : 各子領域都有其研究上面的問題,凡與生醫資訊此大傘相關,dry lab : 實驗的問題,都適用於此板。 : 5. 消息 : 鑑於生醫資訊方面討論的很少。本板除了作為一個問答的論壇以外,也 : 希望板友能提供最新的消息以及知識。不論消息來源是新聞,還是最近 : 發表的期刊,或者來自於研討會的演講,都可以提供消息,亦或可加入 : 一些個人看法以及心得,提昇討論的風氣,刺激板友新的想法與新做法 : 。希望本板能在論壇之外,作為一個蒐集新聞的平台。 : 6. 會議 : 若有相關的研討會,課程以及講習營等消息,只要是開放外界參加的, : 也希望大家提供給有興趣的人知道。 : 因為個人背景的關係,以上討論也不免偏好生資方面,希望有醫資方面的人 : 才來一起參與。另外,本板原本是要由 realism 發起,無奈文章數不夠, : 目前仍在衝文章數中,因此由本人代為發起。不過,我是真的才疏學淺(非 : 自謙),望能拋磚引玉,也希望大家能對於本板板務提供一些意見,謝謝! --



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