作者JosephX (Joseph)
看板bioinfo_lab
标题Re: [问题] 请教生医资料探勘问题
时间Tue May 2 12:02:03 2006
我做成投影片 如果想看图请给我信箱我寄给你
基本上就是利用400次的permutation test 同时计算 P(g, c*) = r
可以画出一个近似常态分布的密度函式 (作业四就是要这个)
接着就可以决定每个基因在 1%, 5% 与 median在其各自密度函式中的临界 r
就这样得到7129个基因各自的临界 r (我设成 rk1, rk5, rkm of the kth gene)
然後只需要根据所需的significant level (如 1%)统计它的总量,
如有多少基因的 ri1 > 0.5 , for i = 1~7129
就可以画出1%的那条曲线
同理就可求 5% 与 median 那两条
※ 引述《Zing119 (哈哈)》之铭言:
: 各位好我是陈小明研究室的学生
: 想请教也有修陈倩瑜老师"生医资料探勘"那堂课的几位学长
: 请问leukemia那篇reading paper中
: fig.2 图中,permuted 1% 5% median那三条曲线是如何产生的??
: 用作业的方式 只能找出原本p(g,c)位於permutation结果多少%的位置呀??
: 抱歉上课没听清楚
: 请学长指点!
: 感谢!!
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 219.91.77.28
1F:推 Zing119:谢谢学长!!! 05/02 16:21
2F:推 agomi:学长好帅~ 学长我也要认识可爱的妹妹~~ 05/03 01:04
3F:推 JosephX:那有什麽问题,但不列入此次考试范围。。 05/03 17:14