year 2001 1.试述三种non-allopatric speciation process 2.试述 allopatric 和 peripatric 不同处 3.在Darwin提出theory of evolution 後， 试述classification和phylogeny之间的关系 4.试各用两句话描述the 3 schools of macrotaxonomy p.120 (一) Phenetics Phenetics 学派学者的分类方法，主要是以 overall similarity 为依据。 他们相信这种分类方法，并不会违反共同祖先的理论，因为亲缘愈近，理应相似性愈高。 (二) Cladistics 此学派企图寻求各生物间的亲缘关系， 藉由建构 cladogram(phylogenetic tree) 来呈现。 (三) Evolutionary classificatin 认为「Cladistics」并未能完全的显现出 evolution 的各种情况。 他们一般采用两阶段方法：第一阶段使用形态的相似性，建构初步的结果； 第二阶段，则是以多种方法验证各类是否 mono- phyletic 且 homogeneous。 5.同一群物种若有两种分（归）类结果，该如何选择为佳？ 6.试述何谓Linnaen hierarchy? 又科(family)的共同字尾为何? 在非正式场合，用何种名字称呼属於同一family的生物？ P.420 The hierarchical arrangement of categorical ranks for taxa in which each category except the lowest includes one or more subordinate categories. P.133 -idae kind 7.请解释何谓distance method 和 UPGMA Distance method : numerical phenetics 的方法：性状距离 UPGMA 是计算性状 cluster 以建构 phenogram 树状图用的方法。 Cluster 後新 taxon 的性状是内含物种的算术平均值。 8.请解释parsimony method和Wagner groundplan divergence method The principle of parsimony: phylogeny of a group is inferred to be the branching pattern requiring the smallest number of evolutionary changes in character states. 9.请问cladistics 和evolutionary taxanomy 对data analysis的看法有何不同? p.250 10.某高中生物课本有叙述如下：「古代鱼类中某一种生物演化成两生类，两生类 中某些生物演化出爬虫类，而爬虫类中某些生物分别演化为鸟类和哺乳类」 试用monophyly, paraphyly, polyphyly观念解释以上叙述可能有什麽错误， 又试改写此段课文，期使能字字符合Cladistics的概念。 以 cladistic 定义之 monophyletic taxon 必须符合包含所有分支 ex-group。 本文中并没有指出「鱼类包含两生类」等分支现象，将两生类等 taxon 自立门户， 使鱼类不符合 Monophyletic Taxon 的规则。如此则鱼类因为没有包含所有 ex-group， 成为 paraphyletic group。 而爬虫与鸟类、哺乳类由「某些生物」演化而成，不符合 branching 必须由 单一 Species 来产生的原则。有可能是以爬虫类指称数种两生类动物趋同演化 後形成的群体。不符合同一 taxon 必有单一祖先物种原则，使爬虫类构成 polyphyletic taxon。鸟类、哺乳类以此类推。 Cladistics 认为 Daughter taxon 必须比 Mother Taxon 在分类层级上低一级。 year 2002 1.考图9-2(p.215) 老师选出其中五个，划底线，要求回答。但是他问什麽我已经忘了。 我印象中只记得其中两个我写了趋同演化。一个写了逆转演化？ 另两个写了英文。 2.考数值分析 老师给出像图11-5那样的表格 要你算出彼此间的distance，填进剩下的空格， 然後画出树枝图，树枝图必须表出彼此间的相近程度。。 老师上课时还强调，树枝图一定要向右对齐。 基本上上课有听，就一定会。 算居离的方法，用的是平方和开根号的欧几里德距离。 虽然是11章的图，但是老师在第9章的时候应该有教。 3.考对於爬虫类这个分类的概念。 印象中，老师在上课时画了一张关於爬虫类鱼类鸟类的分支图， 也包括了他们的分支点。里面都是用英文的名词。 基本上只要默写出来那个图应该就可以了。 不过我还画蛇添足的加上了两学派的不同看法。 如果你们也有抄这个图，应该也是会考的。 4.老师给出五段灵长类动物的genome sequence，应该是同一种protein的sequence 其中一种为人类，然後从sequence的比较之中， 来试着判定其中两种灵长类何者与人类在演化上的关系较接近。 如果上课没教，应该就不会考了吧。 如果有教，原理很简单，应该可以懂的。 以下是不确定的。 5.试述三种non-allopatric speciation process 这题好像跟考古题一样，不过是第五章的。 6.试各用两句话描述the 3 schools of macrotaxonomy 这题跟考古题一样，有重出。 7.试述何谓Linnaen hierarchy? 又科(family)的共同字尾为何? 在非正式场合，用何种名字称呼属於同一family的生物？ 这题也有重出。 8.请解释何谓distance method 和 UPGMA 这题好像有重出。 重点是要弄清楚，两种计算距离的方式有何不同。 一种是利用重心来求，另一种不是。 上课有听就会，老师也许有另外发讲义。 9.请问cladistics 和evolutionary taxanomy 对data analysis的看法有何不同? 这题好像有重出。 10.图11-16 记得是要懂的这个图的意义，加以解说。 --

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