作者freeinmusic (蛤)
看板Statistics
标题[问题] 卡方检定的使用
时间Wed Oct 20 23:07:43 2021
本身是统计新手
最近遇到实验结果需要分析其差异性
但不确定是否是用卡方检定
所以上来请教一下
以下是实验叙述及数据:
某组织是由A,B 两种细胞组成的
我们想知道加药是否能改变某个组织的细胞组成
因此我们对实验动物加药/没加药後取组织出来计算A,B两种细胞百分比，
三重覆後得到数据如下:
第1次实验取出的组织
没加药: A细胞 70% B细胞 30%
有加药: A细胞 40% B细胞 60%
第2次实验取出的组织
没加药: A细胞 72% B细胞 28%
有加药: A细胞 35% B细胞 65%
第3次实验取出的组织
没加药: A细胞 66% B细胞 34%
有加药: A细胞 43% B细胞 57%
我目前的做法是将三次结果平均後得到
没加药: A细胞 69.3% B细胞 30.6%
有加药: A细胞 39.3% B细胞 60.6%
再来用卡分检定计算
但因为我目前看到使用卡方检定的例子里
每一个样本在各类别变项中都是独立的
而我的数据里是一个组织在细胞的类别变相里分别占不同的百分比
然後又有三重覆
因此想询问一下版上的大大们，这种情况是否可以用卡方检定计算呢?
或者是只能用student t-test比较没加药和有加药时A细胞的p值及B细胞的p值呢?
感谢~
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 140.109.32.9 (台湾)
※ 文章网址: https://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/Statistics/M.1634742465.A.4F9.html
1F：→ andrew43: 考虑CMH test，第几次实验视为分层。 10/21 09:16
2F：推 mathchin: 这边看起来观察值是组织里A,B的比例（连续变数），用t-t 10/21 13:14
3F：→ mathchin: est应该可以但n=3好像有点小，卡方一般用在类别变数？ 10/21 13:14
4F：推 andrew43: 看看是不是真的算出细胞个数还是只有百分比。 10/21 17:31
感谢楼上的大大们!!
我没有注意到我的资料的变数是连续变数，看起来我应该用ttest比较正确~
然後n值其实不只3 但怕资料太多打起来太乱所以只列了三个
因为我们的组织个体差异蛮大的，所以如果算细胞个数的话差异会非常大，因此
才会用百分比的方式，不过我会再研究一下CMH test，再次感谢~~
※ 编辑: freeinmusic (140.109.32.9 台湾), 10/22/2021 18:55:49
5F：推 andrew43: 考虑采用配对样本检验。 10/22 19:21
6F：推 zhiying: 如果加药前後是同一只动物的同一个组织，要用配对样本 10/22 23:54
7F：→ zhiying: t检定，如果是不同只动物的组织用ttest就好，还要考虑 10/22 23:54
8F：→ zhiying: 如果每个组织细胞数差很多n又小可能不是常态分布，要用 10/22 23:54
9F：→ zhiying: Mann–Whitney U test (独立）或是Wilcoxon signed-ra 10/22 23:54
10F：→ zhiying: nk test （配对） 10/22 23:54
11F：→ recorriendo: combined test除了用CMH也可以用Liptak method 10/23 14:21
12F：→ recorriendo: 或Fisher method 10/23 14:27