作者ckWade (只好喜欢自己)
看板Statistics
标题Re: [程式] 在R上要算Competing Risk求救
时间Mon Mar 11 14:45:22 2013
: [软体程式类别]:
: R
: [程式问题]:
: Competing Risk
: [软体熟悉度]:
: 新手(不到1个月)
: [问题叙述]:
: 想用R来跑Competing Risk的模型，参照论文是
: Tutorial in biostatistics: Competing risks and multi-state models 这一篇
: 然後我找到了一个叫做cmprsk的package，指令语法是
: crr(ftime,fstatus,cov)，但是我想做的不用到Regression，那cov的部分
: 不知道怎麽处理，我举一下我问题的范例:
: ftime = 5 12 15 16 19 20
: fstatsus = 0 1 1 2 0 1
: 0表示censored data
: 1表示这时间走到state 1
: 2表示这时间走到state 2
: 我要算出S(t),I1(t),I2(t) 应该都是阶梯函数，该如何操作才对?
: ---------------------------------------------------------------------------
: 另外我又遇到了一个package安装上的问题，之前照着步骤下载cmprsk这个package
: 然後程式告诉我说还要load splines survival 这两个package，之前照着做可以执行
:
: 但我R关掉重开之後，package就找不到了，按照上面步骤重新安装一次还是不能执行，
: 是有漏掉什麽步骤吗? 因为刚开始学R很多东西都不熟悉，问题很蠢的话还请多多指教
:
: --
:
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
: ◆ From: 118.167.79.51
: 推 Wush978:先处理後面安装的部份吧。你输入: 03/11 14:15
: → Wush978:install.packages("cmprsk") 之後，错误讯息是什麽呢？ 03/11 14:15
Installing package(s) into ‘C:/Users/L650/Documents/R/win-library/2.15’
(as ‘lib’ is unspecified)
trying URL
'
http://cran.csie.ntu.edu.tw/bin/windows/contrib/2.15/cmprsk_2.2-4.zip'
Content type 'application/zip' length 82329 bytes (80 Kb)
opened URL
downloaded 80 Kb
package ‘cmprsk’ successfully unpacked and MD5 sums checked
The downloaded binary packages are in
C:\Users\L650\AppData\Local\Temp\RtmpgZws8R\downloaded_packages
看起来好像有成功安装package? 但用crr会出现 could not find function "crr"
: → Wush978:另外可以的话，请提供sessionInfo()的输出内容 03/11 14:16
R version 2.15.3 (2013-03-01)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
locale:
[1] LC_COLLATE=Chinese (Traditional)_Taiwan.950
[2] LC_CTYPE=Chinese (Traditional)_Taiwan.950
[3] LC_MONETARY=Chinese (Traditional)_Taiwan.950
[4] LC_NUMERIC=C
[5] LC_TIME=Chinese (Traditional)_Taiwan.950
attached base packages:
[1] splines stats graphics grDevices utils datasets methods
[8] base
other attached packages:
[1] survival_2.37-2
loaded via a namespace (and not attached):
[1] tools_2.15.3
不好意思不知道哪个是重要资讯，所以全部贴上来了，谢谢 @@
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 118.167.79.51
1F：推 Wush978:你使用crr之前有没有先library(cmprsk)呢? 03/11 14:47
2F：→ Wush978:看起来你忘记载入cmprsk了 03/11 14:48
3F：→ ckWade:非常感谢 是我忘了这个步骤!!!! 03/11 14:52