作者cywhale (cywhale)
看板R_Language
标题[问题] sendmailR/mailR on shiny server当掉
时间Tue Jul 28 16:20:54 2015
[问题类型]:
程式谘询(我想用R 做某件事情，但是我不知道要怎麽用R 写出来)
[软体熟悉度]:
请把以下不需要的部份删除
使用者(已经有用R 做过不少作品)
[问题叙述]:
请简略描述你所要做的事情，或是这个程式的目的
我想在shiny server上让client端的使用者可以寄送email给我..
不论是使用sendmailR or mailR套件，在win8.1 Rstudio(or run on browser)
执行shiny::runApp 按下apply_send这个actionbutton，都可以正确寄出、收到email
没问题
但当我将整个shiny app 架在centos系统下的shiny server上时，
若使用sendmailR 套件，这个app其他功能都没问题，但当按下apply_send这个
actionbutton就会挂掉
若使用mailR 套件，这个app变得无法执行，一开始就挂掉。错误讯息跟上面用
sendmailR挂掉时的讯息一样，都是这样的讯息视窗：
"The application unexpectedly exited
Diagostic information has been dumped to the JavaScript error console"
若在browser上按F12看console是否有错误讯息，则发现它在发生上述错误当掉後，又
重新执行server.R一开始library() 那些叙述，然後就hold住。
我在centos这个shiny server上过去跑过几个app都没问题，但这次遇到这样的错误，
google了一些相关sendmailR or mailR网友问答，尝试後仍然找不出问题根源。
我目前试着在centos上灌rstudio-desktop想一步步debug，但奇妙的是，也一直灌不起来
Orz..
不管是用 rpm -Uvh rstudio-0.99.467-x86_64.rpm
错误：相依性侦测失败：
libR.so()(64bit) 被 rstudio-0.99.467-1.x86_64 所需要
libc.so.6(GLIBC_2.14)(64bit) 被 rstudio-0.99.467-1.x86_64 所需要
libc.so.6(GLIBC_2.15)(64bit) 被 rstudio-0.99.467-1.x86_64 所需要
libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.15)(64bit) 被 rstudio-0.99.467-1.x86_64 所需
或者 install from git (follow steps:
https://goo.gl/KmdIVu
卡在 Qt5Webkit这个装不起来
错误：
CMake Error at src/cpp/desktop/CMakeLists.txt:80 (find_package):
By not providing "FindQt5WebKit.cmake" in CMAKE_MODULE_PATH this project
has asked CMake to find a package configuration file provided by
"Qt5WebKit", but CMake did not find one.
我还在持续尝试中... 不知道有无先进，在这几个问题症结上，曾经有过尝试，或遇过
类似的问题，可以指引一个可能可以试看看的方向...谢谢
以下是部分 sendmailR and mailR code in server.R，
这部分在win8.1环境下并无任何问题...
[程式范例]:
...
library(rJava)
#library(sendmailR)
library(mailR)
observeEvent(input$apply_send,{
if (input$apply_send == 0)
return(NULL)
...
isolate ({
# sendmail(from=from,to=to,subject=subject,msg=body,
# control=list(smtpServer="ASPMX.L.GOOGLE.COM",smtpPort="25"))
send.mail(from = from,
to = to,
subject=subject,
body = input$apply_msg,
smtp = list(host.name = "aspmx.l.google.com", port = 25),
authenticate = FALSE, send = TRUE))
})
})
[环境叙述]:
请提供 sessionInfo() 的输出结果，
里面含有所有你使用的作业系统、R 的版本和套件版本资讯，
让版友更容易找出错误
CentOS release 6.5 (Final)
sessionInfo()
R version 3.2.0 (2015-04-16)
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)
Running under: CentOS release 6.5 (Final)
locale:
[1] LC_CTYPE=zh_TW.UTF-8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=zh_TW.UTF-8 LC_COLLATE=zh_TW.UTF-8
[5] LC_MONETARY=zh_TW.UTF-8 LC_MESSAGES=zh_TW.UTF-8
[7] LC_PAPER=zh_TW.UTF-8 LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=zh_TW.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
[关键字]:
shiny server, sendmailR, mailR, CentOS
--
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1F：→ obarisk: java版本问题，可能要用oracle java 07/28 17:48
2F：→ cywhale: Thanks for the keyword, I'll try it tomorrow! 07/28 21:31
3F：→ Wush978: 建议: shiny-server的error log也可以看一看，也许有关键 07/28 22:57
4F：→ cywhale: 换oracle jdk 1.8 R CMD javareconf ok 但情况依旧啊QQ 07/29 22:52
5F：→ cywhale: Wush兄 error log和F12看到的讯息一样没有提供较多资讯>< 07/29 22:53
6F：→ cywhale: 有人知道install rstudio这几个dependency该如何解? 甘温 07/29 22:55
7F：→ obarisk: centos不熟啊，要不要直接用docker比较快 07/30 20:29
8F：→ cywhale: I don't like CentOS but docker is all new for me.. 07/30 21:36
9F：→ cywhale: by the way, finally I fixed the error of shiny app 07/30 21:37
10F：→ cywhale: But still cannot install rstudio correctly 07/30 21:38