作者consley (je ne sais quoi)
看板Python
标题[问题] Biopython处理Genbank file
时间Sat Apr 23 14:05:29 2011
不知道Biopython的问题合不合适
请教板上各位高手
小弟是Biopython新手 很多语法都不熟悉
输入一个.gbk档 从中找出tRNA资讯
(ACCESSION number,第几个tRNA,product还有抓出sequence)
并印出到FASTA file中 如下
>NR12345, tRNA 1, tRNA-Glu
ACGTGTACGTACGTGTACGTACGTGTACGTACGTGTACGTACGTGTACGTCCCCGGGGAT
GCTCTAAGCAACGTGTACGT
>NR12345, tRNA 2, tRNA-Met
CCCCGGGGATCCCCGGGGATCCCCGGGGATCCCCGGGGATCCCCGGGGATATATCGGGAA
CCTGACGTTGCCTGACGTTG
目前以写到可以抓出ACCESSION number,product以及序列所在位置(起迄点)
可是不知道要怎麽去序列里抓出来
希望板上biopython的高手可以相助
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