作者bioeric (ERIC艾瑞克)
看板PhD
标题Re: [问题] 博班生科领域转生资
时间Wed Jul 3 23:48:56 2013
我也是从wet跨dry
生科转生资 刚开始会很挫折
例如MySQL,R,perl......
从无基础到会写的程度大概要1年时间的努力 且这山峰非常的高
相反的 若资讯背景跳进来 反而很容易上手
因为生物资讯并不需要用到很深的分生及代谢理论 更不用去熟练wet实验技能
只要懂点大一程度的生物学就很够用
生物与资讯背景的逻辑思考模式别很大
大学4年+研究所2年的生物训练後 要在资讯领域追上大学就资讯背景的 很难
尤其是年纪已经一大把 20岁这人生最佳学习年纪已过
要发挥生科背景的优势 就是从生科类paper中
学会如何找出题目 用最"简单"的生资方法 去找出答案
因资讯背景 要深入看懂生科类paper也很有难度
不论你是用商业工具或是自己写程式 只要能解决问题 都是好工具
有商业工具可用 就不要浪费时间自己写程式且还不一定写的出来
但走生物资讯可以让你的思考模式
从wet实验室的点攻击模式转向大范围攻击模式(Data mining)
当然还有一个最重要的..........毕业
走wet实验真的是看运气 努力也不一定有收获 且要好几年才发一篇
命不好 怎麽作就是作不出来 9年时间到就掰掰
生资是只要肯作就肯定有data 发paper的时间也短
但......................
出来後 跟生科一样 都很难找工作 薪资也很差
很多资讯背景硕博念生资的 最後都回原本的资讯领域去
生科生资类的薪资在资讯业面前 很可笑
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 36.237.117.160
1F：→ ahot:讲真的,你如果从wet跳到dry,然後有不自己写程式都用套装的 07/04 06:43
2F：→ ahot:那有啥竞争力可言?在pure-dry lab不自己开发程式或是发展方法 07/04 06:44
3F：→ ahot:当你出去社会找工作,不管是业界或是学界,都可以轻易被取代 07/04 06:45
4F：→ ahot:业界老板觉得请你不如请个CS Master.博後那就更不用讲了 07/04 06:47
5F：→ ahot:想走pure dry就不要怕写程式,导方法,用用套件我实验室的tech 07/04 06:48
6F：→ ahot:花个一天研究问问别人也可以轻易上手 07/04 06:49
7F：→ ahot:另外,我不觉得你走dry lab就一定会比做实验的快,当然也要看 07/04 07:01
8F：→ ahot:甚麽实验.另外我不懂你怎麽觉得做分析就一定有data就能发表 07/04 07:02
9F：→ ahot:你确定你拿到的data是第一手还没被发表?你确定有data来源? 07/04 07:03
10F：→ ahot:就算你真的有data好了,你发的是像样的journal? 07/04 07:04
11F：→ ahot:我其实只想说想做跟做的好是不一样的!每个人都不一样所以 07/04 07:06
12F：→ ahot:要想要有所成就,是要有真材实料还要有高人提携 07/04 07:07
13F：→ ahot:大家加油吧!我差的还远勒,一点浅见! 07/04 07:08
14F：推 oplz:他也没说"都"用套装的.. 不用这麽激动. 难道有 trinity 07/04 08:11
15F：→ oplz:Oases 这些不用 非要自己写一个 transcriptome de novo 07/04 08:11
16F：→ oplz:assembler 才叫厉害吗? 07/04 08:12
17F：→ bioeric:举个最简单的例子~几十万笔的NGS注解资料 要做文字切割 07/04 10:31
18F：→ bioeric:可用perl写一串程式 也可用EXCEL的资料剖析简单完成 07/04 10:33
19F：→ ahot:由於我是dry-lab出身,在我的定义里面,可能O大跟B大的理解跟 07/04 10:44
20F：→ ahot:跟我不一样,我觉得要做到最基本像是Rafael Irizary 07/04 10:46
21F：→ ahot:Shirley Liu,Mark Daly, or Mark Gerstein这样才比较像是 07/04 10:48
22F：→ ahot:就是因为你再做dry lab所以你应该要发现以前software的不好 07/04 10:49
23F：→ ahot:加以改进,不然怎麽comp biologist那麽重视 big O或是power 07/04 10:50
24F：→ ahot:做些NGS annotation,写写Perl,应该离comp bio还是太远了 07/04 10:52
25F：→ ahot:不过争论这些也没啥意义,抱歉我有点激动了 07/04 10:53
26F：→ bioeric:了解A大的意思~之前我去大陆上NGS课 发现写程式能力 07/04 11:16
27F：→ bioeric:他们能力超强 且是团体战 每人负责开发一部分 07/04 11:17
28F：→ bioeric:台湾的程度 根本连人家的车尾灯都看不到 07/04 11:17
29F：→ bioeric:在台湾花很大时间学程式去追车尾 也是很难追得上 07/04 11:20
30F：→ bioeric:不如换个思考模式 条条大路通罗马 07/04 11:21
31F：推 ahot:其实你有机会去看看Perl的原始码,或是去看看Bioconductor的 07/04 11:22
32F：→ ahot:原始码,她们写的也没多难,但是这种小圈圈里面自己资讯很快 07/04 11:24
33F：→ ahot:甚至是最可笑的PLINK C code,最重要的是把过程user friendly 07/04 11:25
34F：→ ahot:PLINK只是把常用的统计方法弄成一个套件command line tool 07/04 11:26
35F：→ ahot:多多少少的人在使用,我不觉得这是程式能力的问题,重点是 07/04 11:26
36F：→ ahot:台湾还没人进去这些人的实验室建立关系,再来消息太慢,打不进 07/04 11:27
37F：→ ahot:这些全力圈子,再去看看Goncalo Abecasis的软体,把一个公式 07/04 11:28
38F：→ ahot:写成一个package,多多少少的citation ex:Merlin, Metal 07/04 11:29
39F：→ ahot:这些都是速度问题当然还有权力分享的问题 07/04 11:30
40F：推 lingon:居然在战这个, 有点无聊... 07/04 11:49
41F：→ Narcissuss:模拟很难发好的 07/04 18:33
42F：推 svd0808:看到A大的话，我笑了!每个领域都有不同思维，不要硬套! 07/04 22:28
43F：推 bignumber:其实MySQL, perl, R这些东西也不是CS领域专业的东西 07/04 23:09
44F：→ bignumber:很多国高中生就会了,应该是因为人老了对学新东西的动力 07/04 23:10
45F：→ bignumber:下滑了...像我就对python等语言有点小排斥 07/04 23:12
46F：→ bignumber:写程式的门槛其实应该蛮低的,很多人大学毕业都不会写 07/04 23:15
47F：→ bignumber:进公司把他操个几个月,写出来就有模有样了... 07/04 23:15
48F：→ blence:生物背景觉得资讯转生资比较简单,但资讯背景想法完全相反 07/04 23:54
49F：→ blence:这差不多就是"自己了解的就很简单,不了解的就很困难"的缩影 07/04 23:56
50F：推 kittypudding:我同意楼上的，资讯转生资生物还是要念很多的，不然 07/05 11:18
51F：→ kittypudding:很难找到好的题目和方向，除非和生科老师合作。反之 07/05 11:19
52F：→ kittypudding:也是如此。 07/05 11:19
53F：推 puec2:插嘴一下 我同学EE的也觉得生物的东西很难 07/06 04:22
54F：→ puec2:有些东西对我们来说像呼吸一样理所当然 他们却很难理解 07/06 04:23
55F：→ puec2:光一个Alternative splicing就可以解释很久 07/06 04:23
56F：→ puec2:intron/extron的概念也很难想像 07/06 04:24
57F：→ puec2:Bio的东西不值钱，不表示就很简单喔。 07/06 04:24
58F：推 Narcissuss:如果道德解禁 生物有很多可以玩..... 07/06 10:52