作者chhuang (不要重复制造轮子)
看板perl
标题Re: [问题] 之前问过的程式加了新条件~~
时间Wed Oct 25 10:38:19 2006
忘了说...
搜寻所有 GenBank 的 Viral sequence entries
ORGANISM 包含 Enterovirus
> time perl -w Enterovirus.pl
real 3m55.569s
user 0m0.108s
sys 0m0.144s
Enterovirus.seq:
7780 笔纪录...大小 6885351 (6.6MB)
>gi|116256796|gb|DQ993173.1| Human coxsackievirus A16 isolate 0249-06
TCGGCGGCGGAGACGGGGGCGTCGTCTAATGCTAGTGACAAGAATCTCATTGAGACTAGATGTGTGTTGA
ACCATCACTCCACGCAGGAGACAGCCATTGGAAATTTCTTCAGCCGTGCCGGTCTGGTCAGCATCATTAC
AATGCCCACCACGGGTACACAGAATACAGATGGTTATGTTAATTGGGACATTGACTTGATGGGATATGCT
CAGCTGCGGCGAAAATGCGAGTTGTTTACCTACATGCGCTTTGATGCTGAATTCACATTTGTCGTAGCCA
AACCCAATGGTGAGCTAGTCCCCCAATTACTGCAGTACATGTAYGTCCCCCCCGGSGA
>gi|1839281|gb|S79977.1| swine vesicular disease virus SVDV-specific
AACCATGAAAACCACTGGCGCCTTCGGGCAGCAGTCTGGCGCCGTGTACATAGGCAACTATAGAGTGGTG
AATAGACATCTCGCAACGCGCGCGGACTGGCAAAACTGTGTGTGGGAAGACTACAACAGAGACCTTCTAG
TGAGCACCACCACTGCACATGGTTGCGACACCATTGCCAGGTGCGATTGCACAGCAGGAG
>gi|73533657|gb|DQ167421.1| Human coxsackievirus B3 isolate p19 5' UTR
CAGTCTGTCGTAATGGGCAACTCTGCCGCGGAACCGACTACTTTGGGTGACCGTGTTTCCTTTTATTCTT
ACATTGGCTGCTTATGGTGACAATTGATAATTTGTTACCATATAGCTATTGGATTGGCCATCCGGTA
>gi|73533656|gb|DQ167420.1| Human coxsackievirus B3 isolate p18 5' UTR
CAGTCTGTCGTAATGGGCAACTCTGCCGCGGAACCGACTACTTTGGGTGACCGTGTTTCCTTTTATTCTT
ACATTGGCTGCTTATGGTGACAATTGATAATTTGTTACCATATAGCTATTGGATTGGCCATCCGGTA
>gi|73533655|gb|DQ167419.1| Human coxsackievirus B4 isolate p16 5' UTR
CAGTCTGTCGTAATGGGCAACTCTGCGGCGGAACCGACTACTTTGGGTGACCGTGTTTCCTTTTATTCTT
ACACTGGCTGCTTATGGTGACAATTGATAAATTGTTACCATATAGCTATTGGATTGGCCATCCGGTA
>gi|73533654|gb|DQ167418.1| Human coxsackievirus B4 isolate p14 5' UTR
CAGTCTGTCGTAATGGGCAACTCTGCGGCGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTTATTCTT
ATACTGGCTGCTTATGGTGACAATTGATAGATTGTTACCATATAGCTATTGGATTGGCCATCCGGTA
>gi|73533653|gb|DQ167417.1| Human coxsackievirus B4 isolate p12 5' UTR
CAGTCTGTCGTAATGGGCAACTCTGCGGCGGAACCGACTACTTTGGGTGACCGTGTTTCCTTTTATTCTT
ACACTGGCTGCTTATGGTGACAATTGATAAATTGTTACCATATAGCTATTGGATTGGCCATCCGGTA
>gi|73533652|gb|DQ167416.1| Human coxsackievirus B3 isolate p10 5' UTR
CAGTCTGTCGTAATGGGCAACTCTGCGGCGGAACCGACTACTTTGGGTGACCGTGTTTCCTTTTATTCTT
ACATTGGCTGCTTATGGTGACAATTGATAAATTGTTACCATATAGCTATTGGATTGGCCATCCGGTA
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我是瓶男~我很难懂!
http://blog.yam.com/chhuang
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 61.30.74.102
1F：推 akillerbear:嗯嗯~~大大这个程式是利用POWER SCRIPT吗? 10/25 11:35
2F：推 akillerbear:请问这程式可以让小弟观摩一下吗~THX 10/25 11:41