作者FEmessenger ()
看板perl
标题[请益] 有关基因序列
时间Mon Aug 28 16:45:35 2006
请教各位高手
我现在有一段基因序列
假设是"ATCGAATTCG GCTACTAGCTA TTAGCCCTAA GCGTAAATCG AT"
然後我想设一个长度为 10 个字母的 moving frame 从第一个字母往下一个一个移动检查
一旦遇到在这个 frame 里面 "CG" 含有两个以上 就把这个 frame 回传
以本序列为例
应该会有以下5个符合的结果:
1. "ATCGAATTCG" (起始位置为第1个字母)
^^ ^^
2. "TCGAATTCGG" (起始位置为第2个字母)
^^ ^^
3. "CGAATTCGGC" (起始位置为第3个字母)
^^ ^^
4. "GCGTAAATCG" (起始位置为第31个字母)
^^ ^^
5. "CGTAAATCGA" (起始位置为第32个字母)
^^ ^^
小弟我已经翻遍了 Learning Perl
似乎也没有介绍到与我想要做的事情相关的内容
但我仍觉得 perl 应该还有什麽较方便的函式可以来帮忙处理才对
不晓得各位高手是否能够指点小第一二? 先向大家谢过了~
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