作者plankton (我..凭什麽)
看板perl
标题Re: [问题]关於bioperl:::clustalW
时间Sat Oct 2 02:26:45 2004
※ 引述《seagal (待救的小米)》之铭言：
这位大大..首先非常谢谢你回答我的问题
: 这是我从tutorial cut下来的
: --------------------------------
: use Bio::Tools::Run::Alignment::Clustalw;
: @params = ('ktuple' => 2, 'matrix' => 'BLOSUM');
: $factory = Bio::Tools::Run::Alignment::Clustalw->new(@params);
: $ktuple = 3;
: $factory->ktuple($ktuple); # change the parameter before executing
: $seq_array_ref = \@seq_array;
: # where @seq_array is an array of Bio::Seq objects
: $aln = $factory->align($seq_array_ref);
: --------------------------------
: 你要不要先学tutorial方式
: 先把序列存到@seq_array
: 再去MSA?
^^^?
很抱歉我不知道什麽是MSA..全文是...^_^||
关於tutorial的方式..我大都已经用过了..
所以这个我也试过了^_^|||...
: 这样最保险 因为我想你也是做练习用途
那个....其实并不是上课练习用之类的...谢谢...对我来说非常重要
: 另外 我这边有一些之前去国高教书的范例档
: 刚好就没有clustalW
: 但有其他范例 例如blast
: 都是确定可以跑的
: 看你有没需要拿去练习
好啊~~实在太感谢了...有关blast的程式都好
多看看说不定能找出什麽端倪..谢谢你^_^
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