1.DNA复制包含两原始股的分离，以及以原始股为模板产生两条新股。每一个 新的DNA分子包含一股原始的DNA以及一股新合成的DNA，这种情形称semiconservative replication 2.DNA复制: 1. 单股DNA做为template 2. RNA引子 (primer) 3. dNTP (dATP, dTTP, dCTP, dGTP) 4. DNA 扭转酶 (DNA gyrase) DNA 解旋酶(DNA helicase) DNA 聚合酶 (DNA polymerase) DNA 连接酶 (DNA ligase) 单股结合蛋白质 (SSB) single strand binding protein 3.在复制时，DNA双螺旋由一个特定的点解开，此点称为复制起点(origin of replication，在E. coli中为OriC)。 4.在每个复制起点上，会有两个点(replication forks)是新的聚核苷酸链形成的地方； 在两段原始DNA区域之间之新合成DNA所形成的bubble(也称为eye)构造，显示出两个复 制叉是以相反方向延伸的；这种特色也称为θ结构 5.新合成的DNA有一股(leading strand)是接触3'→5'的模板，以5'→3'的 方向连续地合成；而另一股(lagging strand)则是以小片段半不连续地形成 （semidiscontinuously，在原核生物中主要是1000-2000个核苷酸长度）的， 称为Okazaki fragments 6.lagging strand的片段接下来则藉由DNA ligase将它们连接在一起。 7.一个核苷酸加入成长中DNA链的过程。在成长中DNA链端的3'-OH为亲核剂。 它攻击邻近将要加入成长链核苷酸之糖上的磷。焦磷酸盐被移除而新的磷酸二酯键形成。 8.聚合酶之效用有两种重要考量，就是合成反应的速度(turnover number) 以及持续效能(processivity)，亦即在酵素从模板上分离之前所连结之核苷酸的数目。 9.DNA聚合酶I在复制中有特别的功能: 切除RNA primer和「修补」（patching）DNA DNA聚合酶III是主要负责新合成股之聚合反应的酵素。 10.所有这三个聚合酶都有的3'→5'核酸外切酶的活性，是proofreading 功能的一部分；不正确的核苷酸在复制的过程中被移除，而被正确的所取代， 校正的进行是一次检查一个核苷酸。 11.DNA聚合酶I具有5'→3'核酸外切酶活性，在修复(repair)时负责清除短长度 的核苷酸，通常一次包含几个核苷酸，这也是RNA引子移除的方式。 12.DNA复制时所需要的蛋白质 DNA扭转酶(DNA gyrase，第二型拓朴异构酶)，可以催化将DNA其中一股具有切口而松散、 环状的DNA转换成切口密合的超螺旋形式。 螺旋去稳定(helix-destabilizing)的蛋白质，称为解旋酶(helicase)， 它可以藉着结合在复制叉而促进其松开。 单股结合蛋白质(single-strand binding protein，SSB)，可以藉由与单股 区域的紧密结合而稳定其构造。 13.DNA双股螺旋藉由DNA扭转酶和解旋酶的成用解开而单股DNA覆盖上的SSB (单股DNA结合蛋白质)。引发酶(primase)周期性的在延迟股上准备合成。 复制酶体聚合酶的每一半藉由β-次单元滑动钳与模板结合。DNA聚合酶Ⅰ和DNA连接酶 在延迟股下游移除RNA引子之後以DNA取代它们，并且连接冈崎氏断片。 14.原核细胞DNA复制 (1)DNA合成是双向的，两个复制叉由复制起始点往反方向进行。 (2)DNA合成的方向为新合成股的5’端到3’端。其中一股(领导股)以连续的方式形成。 而另外一股(延迟股)则以不连续方式。在延迟股上小片段的DNA(冈崎氏断片)随後连接起来。 (3)在E.coli中发现五种DNA聚合酶。聚合酶Ⅲ是主要负责合成新股的酵素。 第一个发现的聚合酶(聚合酶Ⅰ)，参与了合成、校正以及修复,聚合酶Ⅱ、Ⅳ和Ⅴ 在特别的情形下为修复酵素。 (4)DNA扭转酶在复制叉更进一步地移动，引发一个旋转点。一种旋转蛋白(亦即解旋酶) 可结合在复制叉的位子，并促进解开螺旋。模板DNA暴露的单股区域藉由DNA 结合蛋白质来稳定。 (5)引发酶催化RNA引子的合成。 (6)新股的合成由聚合酶Ⅲ催化形成。引子藉由聚合酶Ⅰ移除，并以去氧核苷酸取代。 DNA连接酶缝合存在的缺痕。 15. 原核 真核 五种聚合酶(Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ,Ⅴ) 五种聚合酶(α,β,γ,δ,ε) 聚合酶的功能： Ⅰ参与在合成、校正、修以及 α-种聚合酵素 移除RNA的引子 Ⅱ也是修复酵素 β为一种修复酵素 Ⅲ为主要的聚合酵素 γ负责粒线体DNA的合成 Ⅳ,Ⅴ为异常状况下的修复酵素 δ主要的聚合酵素 ε功能未知 是聚合酶也是核酸外切酶 不是所有的聚合酶都为核酸外切酶 一个复制起始点 几个复制起始点 冈崎氏断片约1000-2000个核苷酸长 冈崎氏断片约150-2200个核苷酸长 没有蛋白质复合体与DNA结合 组织蛋白与DNA形成复合体 16.真核生物的染色体是由许多复制起点(也称为复制区，replicators)开始 复制，并完成DNA的合成。人类染色体平均有几百个复制起点，而复制进 行的区域称为复制子(replicons)，其大小随着物种而不同。 (真核有点多 , 有空再补 还是有人愿意帮忙?) 17.RNA转录: (1)单股DNA做为template (模板股) (2)不需引子, 但需要模板股上的DNA 　序列做为启动子 (3)NTP (ATP, UTP, CTP, GTP) (4)RNA 聚合酶 (RNA polymerase) (5)蛋白质 (6)转录作用会产生所有类型的RNA──mRNA、tRNA、rRNA、snRNA、miRNA以及siRNA。 18.RNA合成 : (1)RNA先利用DNA做模板，合成过程叫转录，催化过程之enzyme 是RNA polymerase (2)需要ATP GTP CTP UTP Mg2+ (3)RNA合成不用primer DNA模板还是需要 (4)RNA链由5'→3' 5'连ppp (5)enzyme用DNA其中一股当模板来合成，enzyme和模板结合沿3'→5'移动 (6)模板不改 19.RNA聚合酶(RNA polymerase) 包含 α2ωββ'和σ五种次单元，称为全酶(holoenzyme)。RNA聚合酶(RNA polymerase) 其中σ次单元是很松散地结合在酵素的其他部分(α2ωββ')，称为核心 酵素（core enzyme），参与启动子（promoters）的辨认工作。 α2ωββ'次单元则结合在一起形成聚合反应的活化部位 。 20.模板股(template strand):因为它将用来主导RNA的合成； 而有时也称反义股(antisense strand)，因为其密码互补於将要产生的RNA； 也被称为（-）股（(-)strand）。 另一股称为编码股(coding strand)，因为它的DNA序列与将产生的RNA序 列是相同的(除了以U取代T之外)；而有时它也称为义股(sense strand)， 因为这个RNA序列在mRNA的例子里是我们用来决定将要产生什麽胺基酸的序列； 依惯例它也被称为（+）股((+) strand)，或者为非模板股(nontemplate strand)。 未完成 --

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