作者arokaHTC (阿口力)
看板NCTU-Teacher
标题[心得] 胡毓志 生医资料探勘
时间Thu May 30 16:03:24 2019
⊕课名⊕
资科工所 4IJK 生医资料探勘
▲教授▲
胡毓志
★修课年度★
107-1
£教了什麽£(课程大概内容。或是额外学会了什麽东西。)
1. Introduction to Data mining
2. 很基础的分子生物学 (DNA --转录-> RNA --转译-> 蛋白质)
3. Motif Finding (一级结构)
4. Advanced Motif Finding (二级结构)
5. Decision tree
6. Microarray
7. Evaluation
8. Unbalanced Data
9. Ensemble Learning & Meta Learning
10. 实例:止痛针剂量的 data mining
详见:
https://hackmd.io/s/rymylOppE
◆上课方式◆(投影片、团体讨论、老师教学风格)
上课用自制投影片,但现在不知道还会不会公开到 e3 上。
老师口条算清楚,蛮多东西会讲得很简单,偶尔用版书。
▼考试作业▼
以前的心得文说会投票决定要不要考试,但每年结果都是不考,所以今年就不投票了(?)
25% Quiz (共三次随机小考)
40% Presentation
12% 教授评分
12% 助教评分
16% 同学评分
35% Report
17.5% 教授评分
17.5% 助教评分
期末每次提问加总分 0.5
---小考---
不会事先提前告知小考,因为希望大家来上课,
老师说如果他前一天心情不好可能就会考。
小考大概就三题左右,差不多上次上课内容,
比如说第一次考写出分子生物学中心法则、DNA 硷基有哪四种...(ATCG)
第三次考选择题,用 t-test 做假设检定,哪几个机率分布是合理的(不用算东西)。
---期末 presentation--
选定一篇和生医资料探勘有关的 paper 来报告,present 10 分钟 + Q&A 5 分钟。
也有人挑完全没生医成份的 paper,挑完後寄信给教授,教授回覆没问题就可以。
原则上报难度越高的 paper 分数会越高,
有一些人有生物背景或在做生资的实验室,就挑了生医成分很高的 paper。
在报告前一周要把 paper 和投影片上传,
助教会公开当周要报告的投影片,方便大家提早看。
Present 的分数共 40%
由老师、助教、每一个同学打分数,同学也要听每个人的报告并写评论打分数。
评论同学的内容会再由老师助教打一个分数共 35%,详细的配分写在上面了。
期末报告会有开放提问,每次提问会加总成绩。
¥其他¥(是否注重出席率or严禁迟到?需要的基础?)
要注意一下小考其实有点重,今年的算法一次就占总成绩 8 分
没考到小考的要在期末多问点问题补回来。
去年修课 37 个人,可能平均一周 10 个人报太多了,今年好像有把修课上限人数调降。
¢最後想说的话¢
这门课难度很低、上课很凉,基本上没有什麽门槛
适合完全不熟资料探勘的人,或是没报过 paper 想练习一下读 paper 的人。
但上完这门课也只知道一些生医资料探勘的传统方法、传统问题,不会学到太多资料探勘的东西。
分数有一部分来自其他同学评自己的 present,但是有些人根本就没认真在听...评论直接空白
这部分觉得有点微妙。
大部分的人分数落在 80 几,平均 78,好像被当的就没调分了。
补上成绩分布供参考:
https://i.imgur.com/dC8eVYS.png
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※ 编辑: arokaHTC (140.113.90.112), 05/30/2019 22:57:35
※ 编辑: arokaHTC (140.113.90.112), 05/31/2019 00:02:00
1F:推 qwe19272375: 推心得 06/04 11:49
2F:推 asd2260123: 感谢 刚好想选 06/06 16:47
3F:推 moonoftree: 研究所的课平均 78 好像偏低 06/10 15:47
不算特别甜的课,我是资工大三的时候修,没有修过普生或资料探勘相关课程,最後拿 94,我觉得分数主要是看上课认真程度 (?)
※ 编辑: arokaHTC (140.113.90.112 台湾), 06/10/2019 16:30:08
4F:→ sf163864: 借问他的资料探勘如何 06/11 01:34
5F:推 hpbl: 推 06/11 10:50