※ [本文转录自 Biology 看板] 作者: kissinwang (兔兔世界的王子) 看板: Biology 标题: [讨论]Scientific method - Paper 的整理 时间: Thu Oct 18 02:10:06 2007 『中文版』 【讨论主题】： Scientific methods - Paper 的整理 Excessive trust in authorities and its influence on experimental design 【主题类别】：13.其他：Science method 方法 （1.生化/分子生物 2.细胞/组织/器官 3.神经/行为 4.遗传/发育/分化 5.农业/养殖/食 　品/营养/中草药　6.医药/疾病/免疫/生理 7.模式生物/基因学 8.动物/植物/微生物/ 分类学 9.演化/生态/环保/考古 10.结构/计算生物学　11.生物医学材料/生物医学工 程 12.生物资讯/系统生物学 13.其他 <主要参考：kkcity 的＞) 【资料类别】：口述...孙同天老师的演讲 （书本、期刊、网站、专利、报纸、新闻、口述、杂志、观察......) 【参考资料】：口述 + 孙老师着作收集 Sun TT. 2004. Excessive trust in authorities and its influence on experimental design. Nat Rev Mol Cell Bio 5(7):577-81. （书本章节名、期刊名、网址、专利编号、报纸标题、新闻标题、口述、杂志主题、观察 　现象描述......) 【资料附件】：http://0rz.tw/a43cf （上传利用系统：http://file.chemistry.pu.edu.tw/　静宜应化临时大档案传送系统） （缩址请用：http://0rz.tw/） 【摘要描述】：这篇是说： Most graduate curricula in biological sciences offer courses that cover various scientific disciplines, but they give relatively little formal instruction in experimental design. Students learn the latter primarily through hands-on experience in the laboratory, and some find this learning process bewildering and frustrating. So, what is the root of the problem, and how can young researchers get experiments to work more predictably and reproducibly? 贴自於那篇，他发表的文章，而关於Paper 的整理笔记阿，我引用之前vixen之前发表过 有关於实验纪录软体的文章，我目前将孙老师的这套导入进来，结合 Endnote 做搭配 之前他有提过的问题，我又再次引用放在底下，vixen 老大是使用此来作实验记录整理整 理，他当初提出了几个观点： 想要找个可行的方案, 让三五年後的我, 仍然可以精确搜寻到每一笔纪录. 我需要: 0. 忠实可靠纪录储存各类媒体资料与文件. 1. 个人可以马上使用的软体. 那种给公司的ELN解决方案太遥不可及了, waters等等 2. 可保护资料(如密码), 要可以多方搜寻 3. 可自行备份/还原, 可分享 4. 可以连线, 上网, 最好能够跨平台 (比方在别家实验室想要连线去自家看一下纪录) 这跟 Paper note 是有相等的需求，他那时候也提出了几个软体，并初步了分析一下： 可以想见能符合的软体/服务不会太多, 他搜寻了一下, 目前候选者如下: 1. Google notebook http://www.google.com/notebook/ 这个太阳春了 2. Microsoft OneNote (好贵. 封闭, 而且被MS系列婊到资料挂掉不只一次了, 很怕) 3. 美国DOE解决方案 http://www.csm.ornl.gov/enote/ 4. http://collaboratory.emsl.pnl.gov/software/eln/ 跟上面的很相同 5. http://www.opensourceeln.org Open Source ELN, 没用过 6. Neurosys http://neurosys.cns.montana.edu/ 介面很硬 7. http://cosmodb.sourceforge.jp/en/ CosmoDB, 我很中意但是找不到备份法. 8. http://docs.google.com/?pli=1 友板板友推荐 由於我的英文不太好，里面我可以很流畅的操作就只有不怎麽让人喜爱的微软系列 Microsoft OneNote 我目前使用方式： 1.我会依照不同的主题建置资料档 2.这里面分别有 onenote2个档案 和 endnote 1个档案，还有几个资料夹档(待会介绍) 3.当然我ㄧ直都有个很处女座的烂习惯会在档案前加数字让他们按照我喜欢顺序排排站， 不然我会在电脑前很忧郁不舒服...... 4.onenote的两个档案分别为：第ㄧ就是针对孙老师所说的大多数人的paper 整理 ㄧ张 note 对应着一篇Paper 里面我会写着：Paper主题、我的引用、摘要、内容介绍、 结论、重点(这边的重点当然是我认为的重点...说不定什麽都不是~囧)； 第二就是针对孙老师所提的，同性质的放在一起做探讨的整理笔记，我同性质的东西 都会丢在同一个主题建置资料夹，不过相对的，同ㄧ篇 Paper 它会出现在不同主题的 资料夹内，而这个 onenote档的建置 第ㄧ个就是分类：主题-次主题-次次主题-次次 次主题，例如我在看几丁质，当然这之中有ㄧ堆次主题，然後到我最近探讨到： 几丁质-去乙醯化程度-高效能液像层析(HPLC)法-(诸如计算探讨/紫外光波长探讨/样品 测定影响因素探讨......类似此种方法做note的讨论皆着底下就如孙院士所说的： Paper作者xxx 年代xxxx年 show that xxxxxxxxxxxxxxxx自己很白痴写的话 累积了两篇~~~再用不同的颜色写自己 笨的要死的结论...如(不过我都写不怎麽营养) 这边是onenote方面的使用 5.接着是 endnote 就是每篇相关的都用此列出，包刮中英文的期刊、书本、参考资料、 论文，每篇都连接着PDF档可以直接看原文，找不到电子档的，只有纸本的也扫瞄收录 6.资料夹档有：(档案名称分类) (1).标准作业流程：关於此一主题相关实验的标准作业流程(里面也用不同资料夹收集) 这当中包含实验纪录、实验数据、参考资料等等.......里面亦有 Endnote 和 onenote的整理、试算工具，哪天心血来潮补上...... (2).PDF：放相关的所有PDF档，包含期刊、论文、专利.......Endnote PDF连接也从此 (3).我的最爱：相关网站备份，开启直接连到该网页 (4).Power point：收集到的相关简报档 (5).Word：收集到的文字档；等等有关文字的收集 (6).Excel：相关试算表 (7).PDF备：网上找到，没有跟 ENDNOTE 连接的PDF档 (8).Pic：相关以及所需利用到的图档，(旁边打有关於此部分的论文的图都是从此插入) (9).Others:如使用SAS处理、chemoffice画图、OriginLab的相关处理档案都放此 (无编码).paper.Data:这是 Endnote 自动产生，不给予数字编码自己会沉到最下面 7.除了onenote2个档案 和 endnote 1个档案，还有几个资料夹档之外，其中最重要的就 是我用 word 定义档名为 note 就会对这一系列相关主题做整理，该插图的插图， 该引用 paper 的引用 paper. 8.以上是我目前大概整理的方式....... 【探讨问题】：1.目前备份方式就是多放几个硬碟避免意外，不过endnote 比较麻烦一点 就是当他ㄧ搬家移动位子，就会跑掉，这点让我非常难过。 2.其实其他软体也应该不错使用，可以请板友们也写写使用心得，以及相 关运用给大家参考，或者提供有关教学方面的资讯跟大家分享。 3.对於可以连线, 上网, 最好能够跨平台，我这边目前使用的就是微软的 远端连线 + 开 WEB分享，不过都是我自己用，WEB分享如果要分享给其 他人就是靠权限管理，但是总觉得好麻烦，此方法也不易复制给大家使 用，况且像 ENDNOTE 和 ONENOT 跨平台的问题......远端连线也关系着 连线速度 4.我用的程式并不是每台电脑开开来就可以用，像到图书馆，我要找到特 定电脑，ㄧ楼後方小房间的电脑才可以支援我的远端连线，看的到我需 要什麽书，不然我没带NB就死定了，而且NB这样开，安全性问题也很让 我担心，可是用我家桌机(桌机挂掉一阵子，这阵子看到电脑就讨厌... 懒的修理)又因为频宽因素没这麽顺... 5.根据以上几点，除了自己的分享，也请大家发表意见以及分享讨论 （可依序编号１、２、３、４、５、６......) 【个人推论】：略 （可依序编号１、２、３、４、５、６......) 【其他想说】：最近发了不少P币，PO文跟大家讨论，顺便赚一些回来，不过 PCMAN 最近 心情不太好，我打字打太快它会给我当掉，我打这篇当掉了3次，藉着刚 听完孙老师的演讲，也请大家多多分享整理 Paper 的方法，谢谢。 欢迎将本板加入我的最爱：(C)lass【 分组讨论区 】→11国家研究院 政治, 文学, 学术 →1 Academy 研究 Σ科学学术研究院 → 2ˇBiology 生命 ●全国生物科技转信讨论区● 编号 看 板 类别 转信 中 文 叙 述 人气 板 主 ● 1 ˇBiology 生命 ● 全国生物科技转信讨论区 ● 爆 kissinwang -- 好（坏的）人：对不起！我很想要帮你，不过我找不到帮你的理由..... by kissin my blog = = http://kissinwangblog.spaces.live.com/ 留言给我 http://www.hkflash.com/gb/gb.asp?id=kissinwang 化学/化学工程/生化科技BBS网路资源中心 http://groups.msn.com/chemicalBBScenter Food,Nutrition,& Diet Therapy http://groups.msn.com/FoodNutritionDietTherapy/homepage --

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