作者fauna (黑与白的变幻)
看板Chemistry
标题[资讯] 2013诺贝尔化学奖 颁给计算化学
时间Wed Oct 9 19:00:39 2013
恭喜 Martin Karplus(Harvard), Michael Levitt(Stanford) and Arieh Warshel(USC)
经过了15年 终於又轮回计算化学的领域了
1998年的化学奖颁给了Kohn 和Pople, 他们开创的基础让化学家们有好用的DFT
和Gaussian, 对於小分子的量子化学计算功不可没(相信板友们很多都用过Gaussian
和B3LYP吧)
量子化学透过计算分子中电子的波函数 可以得知分子的特性
并观察和预测化学反应如何进行
然而 以现在的电脑运算速度 模拟超过1000颗原子的系统对量子化学几乎是不可能的任务
所以对於牵涉到蛋白质的生化反应 量子化学只能望之兴叹
这时候就是换multiscale model 出场了
multiscale 的意思 是 先使用量子化学 得到分子键长 键角 弹性常数等参数
再根据这些参数构建出一个简化的分子 如同球被不同弹簧连接
接下来就可以使用分子动力学(molecular dynamics)来研究这些巨大分子如何反应
就好像玩愤怒鸟一样 一开始设定起始条件 然後让分子按照设定的位能面做运动
藉此可以知道这些复杂的分子如何改变构型及反应
在生物体内众多反应的进行和信号的传播 都牵涉到蛋白质分子结构的改变
如果可以预测蛋白质的结构 对於了解疾病的机理 或是药物分子的设计 都有很大的帮助
大家如果之前有下载一个分散式运算软体 用空闲的运算能力计算蛋白质摺叠的计画
就和今年的化学奖是同一件事情
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三个得奖的人里我听过其中两位的演讲
Warshel战力很强 我之前看到他在会议场合战别人XD
我老板对於multiscale的贡献也不小 结果没他的份 帮他哭哭 :~
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◆ From: 131.215.220.166
※ 编辑: fauna 来自: 131.215.220.166 (10/09 19:02)
1F：推 Xepher:近代MD的模拟方法 都是利用此技术 所以真的很强大 10/09 19:06
2F：推 Tamama56:只能推了 10/09 19:41
3F：推 buteo:ChemBark上说Karplas像EJ Corey一样是拿终身成就奖 XD 10/09 20:18
4F：→ buteo:Karplus 打错 10/09 20:18
5F：推 aspeter:是所谓的QM/MM 吗? 10/09 21:59
6F：→ chyuchyu:不是QM/MM, 他们发展的是MD即MM,QM/MM晚很多 10/09 23:00
7F：→ chyuchyu:Karplus也是以不友善出名的。他很厉害，早期做量化理论 10/09 23:01
8F：→ chyuchyu:他有一篇很有名的review,gj;双原子系统的微扰理论 10/09 23:03
9F：→ chyuchyu:小时候念到头差点炸掉 10/09 23:05
10F：→ chyuchyu:说到QM/MM 15年後不知道是不是能得奖，到时候 Morokuma 10/09 23:07
11F：→ chyuchyu:快100岁吧!杨伟涛也是早期QM/MM重要开发者，不知道有没有 10/09 23:08
12F：→ chyuchyu:希望。三个都是MD偏生物系统应用，Bill Miller大概无望了 10/09 23:10
13F：推 sunev:QCFFPI ? 10/10 00:56
14F：推 yamori:所以你老板没希望了吗?再等15年他都要90了XD 10/10 09:56
15F：推 wladimir:据报道说他们都是犹太科学家，真不知道如何识别犹太人 10/10 19:10
16F：→ wladimir:能看出来吗？ 10/10 19:10
17F：推 Adwin:犹太人真的还是比较聪明 10/10 20:07
18F：推 wladimir:今年自然科学奖中，12人中有8个是犹太人 10/10 21:41
19F：→ fauna:QM/MM我觉得还不能让门外汉使用 不像QM 或是MM一样 10/11 11:36
20F：→ fauna:没办法做到让不懂得人也能来跑出一些结果来就不算够普遍 10/11 11:37
21F：→ fauna:现在还看不出得奖的希望 不知道15年後会怎样 10/11 11:38
22F：→ fauna:发布之後我们一群学生围着检讨觉得是我们太废害老板拿不到奖 10/11 11:44
23F：推 wladimir:以色列理工technion在广东建分校，希望能把其先进的教学 10/11 21:23
24F：→ wladimir:带入 10/11 21:23
25F：推 theory:科科，别说QM/MM，一般计算方法如果乱用也是会算出垃圾 10/16 00:12
26F：推 illf:请问f大 你老板是哪位大头呢? 10/20 23:31