作者LIAR (堕天使)
看板Biotech
标题Re: [求救] protein database对应2D PAGE的问题
时间Mon Aug 4 23:08:19 2008
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
: ◆ From: 123.192.40.98
: 推 david31408:看要不要用抗体夹夹看?? 08/02 21:44
: 推 muchmoa:直接查比对到的但白质是不是有subunit就好了吧？有的话 08/03 21:29
: → muchmoa:基本上就是了吧，还有啊...为何会有很多高分的candidate啊 08/03 21:30
: → muchmoa:啊？不够专一吗？挖到其他点吗？我在使用Mascot时都不会设 08/03 21:31
: → muchmoa:定分子量和pI，这样分数会比较高，你可以试试其他DB，说 08/03 21:32
: → muchmoa:不定可以直接match到其subunit 08/03 21:33
其实这是我暑假实验课的内容，所以不可能往下作抗体或是重跑一张2D，
我必须用这仅有的资讯得到最好的答案。
高分啊...比起pI和分子量OK的那个candidate来说，其他我都觉得很高罗！不过即使
如此，高分的coverage也不到15%，实在很难往下猜啊。
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太初有道，道与耶和华同在，道就是耶和华。这道太初与耶和华同在。
万物乃藉祂所造，凡被造的没有一样不是藉着祂所造的。生命在祂里头，
这生命就是人的光。光照在黑暗里，黑暗却不接受光。
吾辈乃生於黑暗，行於黑暗。因神之指引，行向光明；又因撒旦诱惑，回归黑暗。
我不断地徘徊於光明与黑暗之间，从被造之日至今，又自今直到那审判之日的来临。
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◆ From: 123.192.40.98
1F：→ tsubasawolfy:coverage要看protein大小 ... 08/04 23:10
2F：→ tsubasawolfy:然後..2D是个神奇的东西=3= 同个人同sample同机器 08/04 23:10
3F：→ tsubasawolfy:都会有不同的结果=3= 08/04 23:10
4F：推 tsubasawolfy:补完第一个推文好了...coverage只是参考用 不要太迷 08/04 23:13
5F：→ tsubasawolfy:信他 100kD以上有15%就不错了- - 还要考量到实验新手 08/04 23:14
6F：→ tsubasawolfy:操作过程中的一堆误差...所以我觉得硬要去解释打到的 08/04 23:15
7F：→ tsubasawolfy:protein是啥有点牵强(个人意见) 08/04 23:16
8F：推 muchmoa:我的高分是指有超出random match的区域喔，应该不多吧? 08/05 09:28