作者NatureWhy (闯)
看板Biotech
标题[求救] 关於细菌16s rDNA定序使用引子
时间Wed Jun 18 13:55:45 2008
请问如果是一未知菌种利用定序取得16s rDNA序列,再利用BLAST比对搜寻最相近物种
该使用哪一片段引子较好呢?
我看过的资料有只读顺向(519F)取得较短片段
也有读取双向(T7 及 SP6)取得较长片段
但读取双向或单向,或者读取的片段长短不同攸关到所花费成本的高低
请问对於需要做到物种比对而言,该如何选择引子???
如果我只读取单向大概可以得到800-900bp的序列,这长度足以让我辨识物种吗?
谢谢^^
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