作者aggaci (reject!又reject!)
看板Biotech
标题Re: [问题]请问CHIP
时间Mon May 21 21:24:17 2007
※ 引述《yiw (开始)》之铭言:
: 请教版上曾经做过CHIP的高手
: 做了好久的CHIP最後在PCR阶段遇到了困难
: input有出现band但是非常微弱
: 其他IP下的DNA根本就没有讯号
: 参考paper利用RNA Pol II当positive control
: 但是也P不到东西
: 後来觉得可能是DNA品质不好所以测了OD 260/280
: 发现只要是IP下来的DNA ratio都非常低 大概只有1.0左右
: input比较好大概1.5左右
: 我是利用phenol/chloroform/isoamyl alcohol做DNA纯化
: 每次都很小心不要取到有机层
: 但是出来的ratio还是很差
: 请问是不是因为DNA品质的关系所以PCR跑不出来?
: 如果是的话有哪个步骤要小心才能使DNA ratio提高呢?
你sonication玩是否有先跑gel以确定size介於500-1000之间?
还有我现在都不用phenol/chloroform/isoamyl alcohol了
直接用gel elution kit纯化DNA 效果不错!
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.114.100.165
1F:推 yiw:请问是哪一家厂牌的kit呢? 05/21 21:27
2F:推 aggaci:geneaid 05/22 11:20