关於细胞内的酵素反应，大多数还是靠分子间随机碰撞来达成 少数会在酵素复合体中一次完成多个步骤 随机碰撞的参数不是很容易估计，因为跟温度还有酵素的位能井有关 不过酵素跟受质的密度是相对好估计的 以氨基酸来说，细胞中有20种合成蛋白的氨基酸 每一种的浓度都在 1 mM 以上，也就是每 1 um^3 的体积内有超过一百万个氨基酸分子 或说每 (10 nm) 立方的体积就有一个氨基酸分子 另一方面，核糖体的直径大约是 30 nm， 所以可以想像每个核糖体随时随地周围都有数百个氨基酸， 每一种氨基酸大约有10-20个分子，这样的密度是很高的 当然，密度不能直接推论到碰撞频率，这中间还有很多理论 因为氨基酸这种小分子的扩散速率很快，一秒内的机率分布就遍布 1 um^3 的体积 直觉上，中间有机会碰撞到的核糖体应该也很多 但不是所有碰撞都是有效碰撞，还要看分子的 orientation 跟酵素活性口袋的大小 实验数值推断上，蛋白质多肽合成的速率，在细菌里面大约是每秒10个氨基酸 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1164221/ 印象中真核生物的速率更低一些。 这个速率会比上述的碰撞频率更低，因为酵素反应本身也会需要一定时间 ※ 引述《hwider (海里的星辰)》之铭言： : ※ [本文转录自 ask-why 看板 #1UoHldiG ] : 作者: hwider (海里的星辰) 看板: ask-why : 标题: [请益] 细胞里面组装蛋白质的材料会刚好靠过来 : 时间: Sat May 23 20:49:41 2020 : 我一直有个疑问，还没得到解答，就是 : 1.细胞里面胺基酸的浓度分布图， : 2.以及为什麽核糖体在组装多肽链时，胺基酸会自动靠过来？ : 3.还有RNA转录转译时，为什麽哪些材料会自动靠过来？ : 个人闭门造车的想，1.可能哪些胺基酸分布的位置就在核糖体所在的空间中，所以局部胺基 : 酸浓度特别高。并且，此局部细胞质里面有液态地流动，让各种胺基酸冲刷，让核糖体有机 : 会碰到需要的胺基酸。 : 其余2.3.可能也是同样原理，只是不晓得对不对。 -- 1. 似乎在高中学过...的公式 7. 你能测度真正的内心吗? 2. 那真是太令人高兴了 8. 我，真是个笨蛋 3. 已经没什麽好学习的了 9. 那样的公理，我绝不容许 4. 极限、微分，都是存在的 10. 再也不可数的空间维度 5. 怎麽可能会发散 11. 最後收歛的 Banach space 6. 不可积绝对很奇怪啊 12. 我最爱的连续函数 <实分析少女小圆> --

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