作者chengyi31000 (chengyi^^)
看板Biology
标题[问题] otu分析
时间Tue Jun 27 15:52:44 2017
【问题】：
最近老板给的新工作关於肠道维生素
其中有个各个sample 的n个otu 的table
有标记每个otu的界门纲目科属种
想请问该怎麽做分析呢？
【问题起因】：
有看到很多paper会计算a diversity 、b diversity 、unifrac distance 等
但还是不知道怎麽从otu表格转换 进而进行後续分析
【个人看法】：
不知道是不是要用软体进行 还是R package可以使用，再麻烦厉害的高手相助 谢谢
【参考资料/连结】：
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2F：→ lelojack: .html 07/02 00:24
3F：→ lelojack: 有Shannon, Simpson,Reciprocal Simpson Index 07/02 00:26
4F：→ lelojack: 目前我的经验只有这个网站有使用者介面 其他的要写R 写 07/02 00:27
5F：→ lelojack: R是最佳解 07/02 00:27