作者sheepfeather (...)
看板Biology
标题[问题] 关於siRNA的序列以及在mRNA上结合位置的问题
时间Wed May 21 19:10:06 2008
【问题】:
1. 请问一下在siRNA中,对於mRNA上的target site是否有所偏好呢?
我知道miRNA的作用位置是在3'-UTR上,不知道siRNA的情况是?
2. siRNA的序列组成是否有某种规律在? PAZ domain是否会倾向与特定
序列结合呢? 目前只知道需要3'端的2个硷基的overhang
【问题起因】:
大学快毕业了,开始乱看paper而想了解的地方
【个人看法】:
1. 我觉得siRNA与mRNA上的protein coding sequence做结合的话,silence
的效果应该会比较好吧,不知道实际情况是?
2. 有paper说3'overhang跟blunt end的2个硷基如果是 (CA) (GA) (UA)
Dicer在作用上比较有效率,不知道是否可以作为在设计shRNA时的一个筛选标准呢?
希望版友解开我的疑惑~
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※ 编辑: sheepfeather 来自: 140.127.70.237 (05/21 19:15)