作者hajimels (阿一)
看板Biology
标题Re: [问题] 关於生化路径的迷思
时间Thu Apr 10 19:10:59 2008
※ 引述《ericsson (每个人都是贵人)》之铭言:
: 【问题】: 关於生化路径的迷思
: 【问题起因】: 生化路径通常可以分为:
: 代谢反应; 讯号传递; 基因调控等
: 目前不才正在研究的范围局限於代谢环境之模拟,
: 问题来了!~ 老板突然问了一个问题,
: "关於讯号传递及基因调控网路", 可以视为等同代谢网路吗?
: 【个人看法】:
: 对於这个问题因为所看的paper不够广,所以目前还未找到答案,
: 但若就任何反应可以如 A + B ---> C + D
: 那麽, 这个的问题是否就是可以当作一种代谢反应的进行?
: 谢谢各位~~
恩... 其实你的问题 可说是相当复杂耶
这个问题的探讨除了横向metabolic pathway
真正隐含的是
genomics->transcriptomics->proteomics->metabolomics
的纵向关系
其实现在虽然会分说如protein-protein interaction等不同层面的networks
但在生物体上偏偏都是很多层面的networks一起调控 形成同时包含纵向和横向的关系
而你老板所问的问题 我觉得像是跨层次的问题
不能说就是"等同" 但却又是关系重大 很难明确的做出一个定义
而你说的A+B--->C+D要当作代谢的进行 当以metabolomics networks时 可以这样看
不过我想...metabolomics是最复杂的了... 必定得往上个层次回推
把network的观念放宽至不同层次 我想会比较好拉
只不过...
光genomics->transcriptomics->proteomics 这条路的整合问题就多了...>_<
代谢我接触较少 都是玩上述3个层次的关系较多 个人浅见 参考看看就好^^""
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★ミ ζ
○_.
/(╯
【今晚的天空有一颗流星划过 在预言着什麽】|>
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